RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264331.8

TOP2B-201, Transcript of DNA topoisomerase II beta, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TOP2B, Length 5,358 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2B-201ENST00000264331 CEP250Q9BV73 2442 aa6.64□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 A6NNZ2 444 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 KIZQ2M2Z5 673 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 CES3Q6UWW8 571 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 MON1BQ7L1V2 547 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 SCUBE3Q8IX30 993 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 THNSL1Q8IYQ7 743 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 OR52K2Q8NGK3 314 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 A0A0B4J269 797 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 PTMSP20962 102 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 ZACNQ401N2 412 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 CCDC40Q4G0X9 1142 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 DCAF6Q58WW2 860 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 SRLQ86TD4 932 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 SULF1Q8IWU6 871 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 RASGEF1CQ8N431 466 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 AK8Q96MA6 479 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 SPON1Q9HCB6 807 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 RPL10P27635 214 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 MAMLD1Q13495 774 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 SURF1Q15526 300 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 TMEM237Q96Q45 408 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 ARFGAP3Q9NP61 516 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 TMLHEQ9NVH6 421 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 NBASA2RRP1 2371 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 CHD5Q8TDI0 1954 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 SOAT2O75908 522 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 PCP11498 1178 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 ALDH1B1P30837 517 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 SOX5P35711 763 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 GJC1P36383 396 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 SOWAHAQ2M3V2 549 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 FITM2Q8N6M3 262 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 GPR152Q8TDT2 470 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 GOLGA1Q92805 767 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 CFAP57Q96MR6 1250 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 TRIM8Q9BZR9 551 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 DNM3Q9UQ16 869 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 PCDH15Q96QU1 1955 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 SCN4AP35499 1836 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 CCDC169A6NNP5 214 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 LRCH4O75427 683 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 VAMP7P51809 220 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 CLDN10P78369 228 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 GHRHRQ02643 423 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 MBTPS1Q14703 1052 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 RNF207Q6ZRF8 634 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 LPPQ93052 612 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 GPR20Q99678 358 aa6.63□□□□□ -1.35
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TOP2B-201ENST00000264331 SLC17A7Q9P2U7 560 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
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TOP2B-201ENST00000264331 JRKLQ9Y4A0 524 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 GOLGA8KD6RF30 607 aa6.62□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 GOLGA8TH3BQL2 631 aa6.62□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 LSP1P33241 339 aa6.62□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 LRRC63Q05C16 580 aa6.62□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 CPNE9Q8IYJ1 553 aa6.62□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 MMGT1Q8N4V1 131 aa6.62□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 ZNF408Q9H9D4 720 aa6.62□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa6.62□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 A0A087WZ62 844 aa6.62□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa6.62□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 PDXKO00764 312 aa6.62□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 PRSS56P0CW18 603 aa6.62□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 FUT4P22083 530 aa6.62□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 CYP24A1Q07973 514 aa6.62□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 SYPL2Q5VXT5 272 aa6.62□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 HASPINQ8TF76 798 aa6.62□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 CEP170P1Q96L14 293 aa6.62□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 MIPEPQ99797 713 aa6.62□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 GBP3Q9H0R5 595 aa6.62□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 TAOK3Q9H2K8 898 aa6.62□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 COQ4Q9Y3A0 265 aa6.62□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 CCL22O00626 93 aa6.62□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 NRP1O14786 923 aa6.62□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 CAVIN2O95810 425 aa6.62□□□□□ -1.35
TOP2B-201ENST00000264331 SMARCA1P28370 1054 aa6.62□□□□□ -1.35
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