RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249499.7

HOXD9-201, Transcript of homeobox D9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD9, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9-201ENST00000249499 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
HOXD9-201ENST00000249499 NLRP7Q8WX94 980 aa24.33■■□□□ 1.49
HOXD9-201ENST00000249499 ADPGKQ9BRR6 497 aa24.33■■□□□ 1.49
HOXD9-201ENST00000249499 C2CD2Q9Y426 696 aa24.33■■□□□ 1.49
HOXD9-201ENST00000249499 CEP83Q9Y592 693 aa24.33■■□□□ 1.49
HOXD9-201ENST00000249499 A0A1B0GUA9 196 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 GUCY2FP51841 1108 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 MTMR3Q13615 1198 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 SCARA3Q6AZY7 606 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 C1orf127Q8N9H9 656 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 FEZF2Q8TBJ5 459 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 FAM129AQ9BZQ8 928 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 LRRC19Q9H756 370 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 CYP3A43Q9HB55 503 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 SIX4Q9UIU6 781 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 A6NJR5 290 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 DAPK3O43293 454 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 MED7O43513 233 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 TSPAN1O60635 241 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 ERLIN2O94905 339 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 STAU1O95793 577 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 CD58P19256 250 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 MAP2K5Q13163 448 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 AADACL2Q6P093 401 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 LRIG3Q6UXM1 1119 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 JAMLQ86YT9 394 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 RHOT1Q8IXI2 618 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 TMEM192Q8IY95 271 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 SLCO2A1Q92959 643 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 ZIM3Q96PE6 472 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 LHX5Q9H2C1 402 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 IP6K2Q9UHH9 426 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 NFICP08651 508 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 P4HA1P13674 534 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 PTGIRP43119 386 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 JADE1Q6IE81 842 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 TTC39CQ8N584 583 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 CXorf38Q8TB03 319 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 FAM204AQ9H8W3 233 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 CPNE8Q86YQ8 564 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 PARP2Q9UGN5 583 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 ITGA11Q9UKX5 1188 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 STRIP2Q9ULQ0 834 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 NRCAMQ92823 1304 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 TLR3O15455 904 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 F2P00734 622 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 WEE2P0C1S8 567 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 SLC10A6Q3KNW5 377 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 SCLT1Q96NL6 688 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 TRIM7Q9C029 511 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 KRT19P08727 400 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 BRD2P25440 801 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 COILP38432 576 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 GRM5P41594 1212 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 TMEM132DQ14C87 1099 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP24.29■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 KATNAL2Q8IYT4 538 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 C18orf8Q96DM3 657 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 CPB2Q96IY4 423 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 ACAP3Q96P50 834 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 TRIM51Q9BSJ1 452 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 HOMER3Q9NSC5 361 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 DERAQ9Y315 318 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 TMEM88BA6NKF7 163 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 RARAP10276 462 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 PIK3R5Q8WYR1 880 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 NEUROG2Q9H2A3 272 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 GOLGA6CA6NDK9 693 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 TMEM191CA6NGB0 347 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 ITGB3P05106 788 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 GOLGA6DP0CG33 693 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 GYS2P54840 703 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 GSCP56915 257 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 WDR72Q3MJ13 1102 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 LRRC38Q5VT99 294 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 FAM76AQ8TAV0 307 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 FMO2Q99518 471 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
HOXD9-201ENST00000249499 ADAMTS10Q9H324 1103 aa24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.5 ms