RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613394.4

HPS1-215, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HPS1, Length 3,714 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-215ENST00000613394 LMO3Q8TAP4 145 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 CRYGNQ8WXF5 182 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 FZD1Q9UP38 647 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 CBX6O95503 412 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 PSMA2P25787 234 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 LVRNQ6Q4G3 990 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 SLC9A9Q8IVB4 645 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 FAM151AQ8WW52 585 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 STMN2Q93045 179 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 FAM81BQ96LP2 452 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 GINS2Q9Y248 185 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 CYP1A2P05177 515 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 NR3C2P08235 984 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 KRT4P19013 534 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 ADSSP30520 456 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 CAV1Q03135 178 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 SLC27A3Q5K4L6 730 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 MFSD7Q6UXD7 560 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 DTX3LQ8TDB6 740 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 ATG4CQ96DT6 458 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 ADAM7Q9H2U9 754 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 ZFP69BQ9UJL9 534 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 SPDYE2BA6NHP3 402 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 H7C0C1 242 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 ICAM1P05362 532 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 CFHP08603 1231 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 SPDYE6P0CI01 402 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 GTF2H1P32780 548 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 CAP2P40123 477 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 ATP5OP48047 213 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 LMNB2Q03252 620 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 MDH1BQ5I0G3 518 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 LONP2Q86WA8 852 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 NIM1KQ8IY84 436 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 BSNDQ8WZ55 320 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 LRRC19Q9H756 370 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 PROSCO94903 275 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 MT-ND3P03897 115 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 TMEM191BP0C7N4 346 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 PRKCEQ02156 737 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 MPP2Q14168 576 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 EMC10Q5UCC4 262 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 HELQQ8TDG4 1101 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 JDP2Q8WYK2 163 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 MAML1Q92585 1016 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 CFAP36Q96G28 342 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 PSAPP07602 524 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 KITP10721 976 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 SSTR1P30872 391 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 PIGWQ7Z7B1 504 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 CKAP2Q8WWK9 683 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 SEC14L1Q92503 715 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 RILPQ96NA2 401 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 SCINQ9Y6U3 715 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 F8VP50 259 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 FSCN2O14926 492 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 GSTA1P08263 222 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 YY1P25490 414 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 CCND2P30279 289 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 PHBP35232 272 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 SLC1A1P43005 524 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 CPA2P48052 419 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 RASSF2P50749 326 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 GTF2BQ00403 316 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 HIF1AQ16665 826 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 CCDC62Q6P9F0 684 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 HERPUD2Q9BSE4 406 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 PICK1Q9NRD5 415 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 SCN7AQ01118 1682 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 INHBAP08476 426 aa14.58□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 NCOA4Q13772 614 aa14.58□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 VSTM1Q6UX27 236 aa14.58□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 FAM228AQ86W67 206 aa14.58□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 LMNTD2Q8IXW0 634 aa14.58□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 KCTD6Q8NC69 237 aa14.58□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 MCPH1Q8NEM0 835 aa14.58□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 MYLK2Q9H1R3 596 aa14.58□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 FBXO40Q9UH90 709 aa14.58□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 CHMP2BQ9UQN3 213 aa14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms