RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa25.71■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM189A1O60320 539 aa25.7■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C22orf31O95567 290 aa25.7■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 INSRRP14616 1297 aa25.7■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GPC5P78333 572 aa25.7■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TFDP1Q14186 410 aa25.7■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ODF2Q5BJF6 829 aa25.7■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BRSK2Q8IWQ3 736 aa25.7■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EVPLQ92817 2033 aa25.7■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C5orf60A6NFR6 353 aa25.69■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GZMAP12544 262 aa25.69■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TMEM132AQ24JP5 1023 aa25.69■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KATNBL1Q9H079 304 aa25.69■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM187AA6NFU0 413 aa25.69■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 B4GALT5O43286 388 aa25.69■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PPTC7Q8NI37 304 aa25.69■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM81BQ96LP2 452 aa25.69■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PPP1R16BQ96T49 567 aa25.69■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa25.68■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GRB14Q14449 540 aa25.68■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SCARA3Q6AZY7 606 aa25.68■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZDHHC24Q6UX98 284 aa25.68■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ALG6Q9Y672 507 aa25.68■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OGTO15294 1046 aa25.68■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TCEAL1Q15170 157 aa25.68■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AADACL2Q6P093 401 aa25.68■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 JAMLQ86YT9 394 aa25.68■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MAML3Q96JK9 1138 aa25.68■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MINDY3Q9H8M7 445 aa25.68■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ABLIM1O14639 778 aa25.67■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NUDT17P0C025 328 aa25.67■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PTGIRP43119 386 aa25.67■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DRG2P55039 364 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MCL1Q07820 350 aa25.67■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF484Q5JVG2 852 aa25.67■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ATF7IP2Q5U623 682 aa25.67■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C11orf63Q6NUN7 778 aa25.67■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UMODL1Q5DID0 1318 aa25.67■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ACKR2O00590 384 aa25.67■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SHBGP04278 402 aa25.67■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OSTNP61366 133 aa25.67■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NOP14P78316 857 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CUL2Q13617 745 aa25.67■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NCOA4Q13772 614 aa25.67■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM110CQ1W6H9 321 aa25.67■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF568Q3ZCX4 644 aa25.67■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PLEKHH3Q7Z736 793 aa25.67■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 THNSL1Q8IYQ7 743 aa25.67■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FZD8Q9H461 694 aa25.67■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP25.67■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa25.66■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CAND2O75155 1236 aa25.66■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MBTD1Q05BQ5 628 aa25.66■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CLUL1Q15846 466 aa25.66■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MPZL3Q6UWV2 235 aa25.66■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa25.66■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRT35Q92764 455 aa25.66■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF653Q96CK0 615 aa25.66■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MTMR12Q9C0I1 747 aa25.66■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NUB1Q9Y5A7 615 aa25.66■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IFFO1Q0D2I5 559 aa25.65■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCDC13Q8IYE1 715 aa25.65■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 H0YHG0 523 aa25.65■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MARCKSL1P49006 195 aa25.65■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EEF1DP3Q658K8 133 aa25.65■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 WDR49Q8IV35 697 aa25.65■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa25.65■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRELID2Q8N945 189 aa25.65■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C18orf8Q96DM3 657 aa25.65■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SEC16BQ96JE7 1060 aa25.65■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CABS1Q96KC9 395 aa25.65■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GRHL1Q9NZI5 618 aa25.65■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SNX24Q9Y343 169 aa25.65■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa25.65■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ASAP2O43150 1006 aa25.64■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PHF2O75151 1096 aa25.64■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CLTAP09496 248 aa25.64■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IQCF3P0C7M6 154 aa25.64■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SMPD1P17405 629 aa25.64■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PMS2P54278 862 aa25.64■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CEP120Q8N960 986 aa25.64■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FBXO25Q8TCJ0 367 aa25.64■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms