RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560971.1

GCSHP2-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene GCSHP2, Length 527 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP2-201ENST00000560971 C1orf127Q8N9H9 656 aa20.11■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 HDAC7Q8WUI4 952 aa20.11■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 CCDC34Q96HJ3 373 aa20.11■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa20.11■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 SENP8Q96LD8 212 aa20.11■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 RIPOR3Q96MK2 946 aa20.11■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 DPP7Q9UHL4 492 aa20.11■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 FBXL5Q9UKA1 691 aa20.11■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 FBXW11Q9UKB1 542 aa20.11■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 H7C4K7 107 aa20.1■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 ITGB3P05106 788 aa20.1■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 SP100P23497 879 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 MTHFRP42898 656 aa20.1■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC8B1Q6J4K2 584 aa20.1■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa20.1■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 OR5B17Q8NGF7 314 aa20.1■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 GOLGA5Q8TBA6 731 aa20.1■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP20.1■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 MTMR12Q9C0I1 747 aa20.1■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 AGAP1Q9UPQ3 857 aa20.1■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 EXOC3O60645 756 aa20.09■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 TAF6P49848 677 aa20.09■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 ROR1Q01973 937 aa20.09■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 CYP24A1Q07973 514 aa20.09■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF280DQ6N043 979 aa20.09■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa20.09■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 CXorf38Q8TB03 319 aa20.09■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 CCDC127Q96BQ5 260 aa20.09■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 TIGD1Q96MW7 591 aa20.09■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 NECTIN4Q96NY8 510 aa20.09■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 INTS13Q9NVM9 706 aa20.09■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 WDR27A2RRH5 827 aa20.08■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 LOC730098B7Z3J9 87 aa20.08■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 PDXKO00764 312 aa20.08■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 ZMYND10O75800 440 aa20.08■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 OAZ2O95190 189 aa20.08■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 TMEM191BP0C7N4 346 aa20.08■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 DLATP10515 647 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 SURF1Q15526 300 aa20.08■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa20.08■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 USP37Q86T82 979 aa20.08■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 BORCS6Q96GS4 357 aa20.08■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa20.08■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 DMAC2Q9NW81 257 aa20.08■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa20.08■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 SIX4Q9UIU6 781 aa20.08■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 ITGA11Q9UKX5 1188 aa20.08■□□□□ 0.81
GCSHP2-201ENST00000560971 NCOR1O75376 2440 aa20.08■□□□□ 0.8
GCSHP2-201ENST00000560971 CYB561D2O14569 222 aa20.07■□□□□ 0.8
GCSHP2-201ENST00000560971 ABLIM3O94929 683 aa20.07■□□□□ 0.8
GCSHP2-201ENST00000560971 NR3C1P04150 777 aa20.07■□□□□ 0.8
GCSHP2-201ENST00000560971 C8AP07357 584 aa20.07■□□□□ 0.8
GCSHP2-201ENST00000560971 KRT19P08727 400 aa20.07■□□□□ 0.8
GCSHP2-201ENST00000560971 ODC1P11926 461 aa20.07■□□□□ 0.8
GCSHP2-201ENST00000560971 TYMPP19971 482 aa20.07■□□□□ 0.8
GCSHP2-201ENST00000560971 PAX3P23760 479 aa20.07■□□□□ 0.8
GCSHP2-201ENST00000560971 PSMD6Q15008 389 aa20.07■□□□□ 0.8
GCSHP2-201ENST00000560971 DUOXA2Q1HG44 320 aa20.07■□□□□ 0.8
GCSHP2-201ENST00000560971 LIN9Q5TKA1 542 aa20.07■□□□□ 0.8
GCSHP2-201ENST00000560971 OVOS1Q6IE37 1185 aa20.07■□□□□ 0.8
GCSHP2-201ENST00000560971 WDR49Q8IV35 697 aa20.07■□□□□ 0.8
GCSHP2-201ENST00000560971 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF461Q8TAF7 563 aa20.07■□□□□ 0.8
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC7A14Q8TBB6 771 aa20.07■□□□□ 0.8
GCSHP2-201ENST00000560971 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
GCSHP2-201ENST00000560971 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa20.07■□□□□ 0.8
GCSHP2-201ENST00000560971 MFSD14AQ96MC6 490 aa20.07■□□□□ 0.8
GCSHP2-201ENST00000560971 PRKD2Q9BZL6 878 aa20.07■□□□□ 0.8
GCSHP2-201ENST00000560971 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa20.07■□□□□ 0.8
GCSHP2-201ENST00000560971 SCN1AP35498 2009 aa20.07■□□□□ 0.8
GCSHP2-201ENST00000560971 KPNA7A9QM74 516 aa20.06■□□□□ 0.8
GCSHP2-201ENST00000560971 KINO60870 393 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
GCSHP2-201ENST00000560971 KIF20AO95235 890 aa20.06■□□□□ 0.8
GCSHP2-201ENST00000560971 PAPLNO95428 1278 aa20.06■□□□□ 0.8
GCSHP2-201ENST00000560971 TNNC2P02585 160 aa20.06■□□□□ 0.8
GCSHP2-201ENST00000560971 OR4Q2P0C623 313 aa20.06■□□□□ 0.8
GCSHP2-201ENST00000560971 CASP4P49662 377 aa20.06■□□□□ 0.8
GCSHP2-201ENST00000560971 SV2CQ496J9 727 aa20.06■□□□□ 0.8
GCSHP2-201ENST00000560971 PPM1LQ5SGD2 360 aa20.06■□□□□ 0.8
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC9A9Q8IVB4 645 aa20.06■□□□□ 0.8
GCSHP2-201ENST00000560971 SPATA20Q8TB22 786 aa20.06■□□□□ 0.8
GCSHP2-201ENST00000560971 PLEKHO2Q8TD55 490 aa20.06■□□□□ 0.8
GCSHP2-201ENST00000560971 TMEM174Q8WUU8 243 aa20.06■□□□□ 0.8
GCSHP2-201ENST00000560971 SMARCE1Q969G3 411 aa20.06■□□□□ 0.8
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF560Q96MR9 790 aa20.06■□□□□ 0.8
GCSHP2-201ENST00000560971 FNBP1Q96RU3 617 aa20.06■□□□□ 0.8
GCSHP2-201ENST00000560971 RMND1Q9NWS8 449 aa20.06■□□□□ 0.8
GCSHP2-201ENST00000560971 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa20.06■□□□□ 0.8
GCSHP2-201ENST00000560971 CCL16O15467 120 aa20.05■□□□□ 0.8
GCSHP2-201ENST00000560971 CALUO43852 315 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
GCSHP2-201ENST00000560971 SMC2O95347 1197 aa20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms