RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559494.1

TSPAN3-207, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TSPAN3, Length 1,326 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-207ENST00000559494 VAMP7P51809 220 aa21.88■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 KCNC3Q14003 757 aa21.88■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 FOXR2Q6PJQ5 311 aa21.88■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 DSTYKQ6XUX3 929 aa21.88■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 VN1R2Q8NFZ6 395 aa21.88■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 MED15Q96RN5 788 aa21.88■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa21.88■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 FNIP2Q9P278 1114 aa21.88■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 BICDL2A1A5D9 508 aa21.87■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 GLP2RO95838 553 aa21.87■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 KLRC2P26717 231 aa21.87■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 LTBRP36941 435 aa21.87■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 PSMD5Q16401 504 aa21.87■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 DPCR1Q3MIW9 517 aa21.87■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 CCDC183Q5T5S1 534 aa21.87■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 LRRC52Q8N7C0 313 aa21.87■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 SLC22A17Q8WUG5 538 aa21.87■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 CLSTN3Q9BQT9 956 aa21.87■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP21.87■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 CLDND1Q9NY35 253 aa21.87■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 KPNA7A9QM74 516 aa21.86■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 IKBKBO14920 756 aa21.86■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 ADAM12O43184 909 aa21.86■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 EPB41P11171 864 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 KRT13P13646 458 aa21.86■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 PNPLA4P41247 253 aa21.86■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 AP3M2P53677 418 aa21.86■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 BFSP1Q12934 665 aa21.86■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa21.86■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 HLA-CQ95604 372 aa21.86■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 CEP63Q96MT8 703 aa21.86■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 RWDD2AQ9UIY3 292 aa21.86■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 TBC1D4O60343 1298 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 TRIM49P0CI25 452 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 TRIM49CP0CI26 452 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 ENPEPQ07075 957 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 SV2CQ496J9 727 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 LLGL2Q6P1M3 1020 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 PDXDC1Q6P996 788 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 EP400NLQ6ZTU2 488 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 ANKS3Q6ZW76 656 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 GLYCTKQ8IVS8 523 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 APPL2Q8NEU8 664 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 ZNF560Q96MR9 790 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 MTRRQ9UBK8 725 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 BACE2Q9Y5Z0 518 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 CYB561D2O14569 222 aa21.84■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 ADH1AP07327 375 aa21.84■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 EPCAMP16422 314 aa21.84■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 TYMPP19971 482 aa21.84■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 CLCN4P51793 760 aa21.84■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 PPP3CAQ08209 521 aa21.84■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa21.84■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 SV2AQ7L0J3 742 aa21.84■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 PPFIBP1Q86W92 1011 aa21.84■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 HPDLQ96IR7 371 aa21.84■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 CLEC1BQ9P126 229 aa21.84■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 COG5Q9UP83 839 aa21.84■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 TBX10O75333 385 aa21.83■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 OAZ2O95190 189 aa21.83■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 VNN1O95497 513 aa21.83■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 CYP11A1P05108 521 aa21.83■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 OR1D2P34982 312 aa21.83■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 NDUFV1P49821 464 aa21.83■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 CREMQ03060 361 aa21.83■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 ZACNQ401N2 412 aa21.83■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 LILRA6Q6PI73 481 aa21.83■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 USP37Q86T82 979 aa21.83■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 PALB2Q86YC2 1186 aa21.83■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 GDAP2Q9NXN4 497 aa21.83■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
TSPAN3-207ENST00000559494 FSD2A1L4K1 749 aa21.82■■□□□ 1.08
TSPAN3-207ENST00000559494 H7C4K7 107 aa21.82■■□□□ 1.08
TSPAN3-207ENST00000559494 PHACTR2O75167 634 aa21.82■■□□□ 1.08
TSPAN3-207ENST00000559494 ODC1P11926 461 aa21.82■■□□□ 1.08
TSPAN3-207ENST00000559494 KCNA5P22460 613 aa21.82■■□□□ 1.08
TSPAN3-207ENST00000559494 GCLMP48507 274 aa21.82■■□□□ 1.08
TSPAN3-207ENST00000559494 MYL6P60660 151 aa21.82■■□□□ 1.08
TSPAN3-207ENST00000559494 TFF2Q03403 129 aa21.82■■□□□ 1.08
TSPAN3-207ENST00000559494 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
TSPAN3-207ENST00000559494 BIRC3Q13489 604 aa21.82■■□□□ 1.08
TSPAN3-207ENST00000559494 KLHL40Q2TBA0 621 aa21.82■■□□□ 1.08
TSPAN3-207ENST00000559494 CTXN3Q4LDR2 81 aa21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.5 ms