RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 TXNDC8Q6A555 127 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 NAT16Q8N8M0 369 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 OR6B3Q8NGW1 331 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 RAD54LQ92698 747 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 KIFAP3Q92845 792 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 PDLIM2Q96JY6 352 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 FZD8Q9H461 694 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 TRIP11Q15643 1979 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 ASAP2O43150 1006 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 TMEM191BP0C7N4 346 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 CCR2P41597 374 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 NDUFA8P51970 172 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 SLC12A3P55017 1021 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 RBL2Q08999 1139 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 NAALADL2Q58DX5 795 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 TAF3Q5VWG9 929 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 CRIPAKQ8N1N5 446 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 EFHBQ8N7U6 833 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 COL1A2P08123 1366 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 CYB561D2O14569 222 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 TOM1L1O75674 476 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 F13A1P00488 732 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 SOD2P04179 222 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 ZNF445P59923 1031 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 STK4Q13043 487 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 MPZL3Q6UWV2 235 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 ADHFE1Q8IWW8 467 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 SENP8Q96LD8 212 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 FNBP1Q96RU3 617 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 ZBP1Q9H171 429 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP8.15□□□□□ -1.12e-6■■■■■ 114.2
CS-212ENST00000548567 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.11
CS-212ENST00000548567 CST3P01034 146 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.11
CS-212ENST00000548567 GABRR2P28476 465 aa8.15□□□□□ -1.11
CS-212ENST00000548567 USP8P40818 1118 aa8.15□□□□□ -1.11
CS-212ENST00000548567 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP8.15□□□□□ -1.112e-6■□□□□ 8.3
CS-212ENST00000548567 PPP2R3AQ06190 1150 aa8.15□□□□□ -1.11
CS-212ENST00000548567 LEXMQ3ZCV2 418 aa8.15□□□□□ -1.11
CS-212ENST00000548567 TANGO2Q6ICL3 276 aa8.15□□□□□ -1.11
CS-212ENST00000548567 OVOS1Q6IE37 1185 aa8.15□□□□□ -1.11
CS-212ENST00000548567 SLC39A4Q6P5W5 647 aa8.15□□□□□ -1.11
CS-212ENST00000548567 MOXD1Q6UVY6 613 aa8.15□□□□□ -1.11
CS-212ENST00000548567 PRR23BQ6ZRT6 265 aa8.15□□□□□ -1.11
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CS-212ENST00000548567 LINC00301Q8NCQ3 95 aa8.15□□□□□ -1.11
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CS-212ENST00000548567 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa8.15□□□□□ -1.11
CS-212ENST00000548567 LTBP2Q14767 1821 aa8.15□□□□□ -1.11
CS-212ENST00000548567 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa8.14□□□□□ -1.11
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CS-212ENST00000548567 RHOP08100 348 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-212ENST00000548567 ADSSP30520 456 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-212ENST00000548567 GDI1P31150 447 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-212ENST00000548567 TRAPPC10P48553 1259 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-212ENST00000548567 TEAD2Q15562 447 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-212ENST00000548567 IQCEQ6IPM2 695 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-212ENST00000548567 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-212ENST00000548567 CEP57L1Q8IYX8 460 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-212ENST00000548567 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
CS-212ENST00000548567 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
CS-212ENST00000548567 FAM122AQ96E09 287 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-212ENST00000548567 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
CS-212ENST00000548567 CRACR2AQ9BSW2 395 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-212ENST00000548567 BRD9Q9H8M2 597 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-212ENST00000548567 CHST12Q9NRB3 414 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-212ENST00000548567 COX16Q9P0S2 106 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-212ENST00000548567 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
CS-212ENST00000548567 KCNH3Q9ULD8 1083 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-212ENST00000548567 TRIM49BA6NDI0 452 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-212ENST00000548567 GOLGA6L22H0YM25 854 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-212ENST00000548567 CAND2O75155 1236 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-212ENST00000548567 BDNFP23560 247 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-212ENST00000548567 GCLMP48507 274 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-212ENST00000548567 CLCN4P51793 760 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-212ENST00000548567 DLG4P78352 724 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-212ENST00000548567 TMEM132DQ14C87 1099 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-212ENST00000548567 PTPAQ15257 358 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-212ENST00000548567 CTC1Q2NKJ3 1217 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-212ENST00000548567 KLHL40Q2TBA0 621 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-212ENST00000548567 C2orf27AQ580R0 203 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-212ENST00000548567 POTEHQ6S545 545 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-212ENST00000548567 LRRTM3Q86VH5 581 aa8.14□□□□□ -1.11
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