RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531995.1

PUF60-218, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-218ENST00000531995 TMEM174Q8WUU8 243 aa20.19■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 RSAD2Q8WXG1 361 aa20.19■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 FAM213AQ9BRX8 229 aa20.19■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 COLEC11Q9BWP8 271 aa20.19■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 NUP62CLQ9H1M0 184 aa20.19■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 HSPBP1Q9NZL4 362 aa20.19■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 CNTN3Q9P232 1028 aa20.19■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 ADAM28Q9UKQ2 775 aa20.19■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 FBXL21Q9UKT6 434 aa20.19■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 DUSP12Q9UNI6 340 aa20.19■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 DOCK6Q96HP0 2047 aa20.19■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 LACTBL1A8MY62 500 aa20.18■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 PDXKO00764 312 aa20.18■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 ZBTB6Q15916 424 aa20.18■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 KYAT1Q16773 422 aa20.18■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 ZCWPW2Q504Y3 356 aa20.18■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 ARMCX5Q6P1M9 558 aa20.18■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa20.18■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 TMEM130Q8N3G9 435 aa20.18■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa20.18■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 RXFP1Q9HBX9 757 aa20.18■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa20.18■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 CITO14578 2027 aa20.17■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 TGM5O43548 720 aa20.17■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 EXTL3O43909 919 aa20.17■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 MBD3O95983 291 aa20.17■□□□□ 0.82
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PUF60-218ENST00000531995 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 USP41Q3LFD5 358 aa20.17■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 GLRA4Q5JXX5 417 aa20.17■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 RTP2Q5QGT7 225 aa20.17■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 CENPPQ6IPU0 288 aa20.17■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 SLC9A9Q8IVB4 645 aa20.17■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 SIX5Q8N196 739 aa20.17■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 MYADMQ96S97 322 aa20.17■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 CHST7Q9NS84 486 aa20.17■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 ANK1P16157 1881 aa20.17■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 KIF4AO95239 1232 aa20.16■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 THP07101 528 aa20.16■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 CFHP08603 1231 aa20.16■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 NUBP1P53384 320 aa20.16■□□□□ 0.82
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PUF60-218ENST00000531995 CBWD2Q8IUF1 395 aa20.16■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 GPD1LQ8N335 351 aa20.16■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa20.16■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 PIDD1Q9HB75 910 aa20.16■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 LDHAP00338 332 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 NFIL3Q16649 462 aa20.15■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 ANKRD40Q6AI12 368 aa20.15■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 HS2ST1Q7LGA3 356 aa20.15■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 BRSK2Q8IWQ3 736 aa20.15■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 TRIML1Q8N9V2 468 aa20.15■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 GOLGA5Q8TBA6 731 aa20.15■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 TMEM63CQ9P1W3 806 aa20.15■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 DPP7Q9UHL4 492 aa20.15■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 PI15O43692 258 aa20.14■□□□□ 0.81
PUF60-218ENST00000531995 TADA2AO75478 443 aa20.14■□□□□ 0.81
PUF60-218ENST00000531995 KIF20AO95235 890 aa20.14■□□□□ 0.81
PUF60-218ENST00000531995 NR3C1P04150 777 aa20.14■□□□□ 0.81
PUF60-218ENST00000531995 NPR3P17342 541 aa20.14■□□□□ 0.81
PUF60-218ENST00000531995 CYP2J2P51589 502 aa20.14■□□□□ 0.81
PUF60-218ENST00000531995 CLCN5P51795 746 aa20.14■□□□□ 0.81
PUF60-218ENST00000531995 TUSC3Q13454 348 aa20.14■□□□□ 0.81
PUF60-218ENST00000531995 MYBPC2Q14324 1141 aa20.14■□□□□ 0.81
PUF60-218ENST00000531995 CD300LGQ6UXG3 332 aa20.14■□□□□ 0.81
PUF60-218ENST00000531995 XXYLT1Q8NBI6 393 aa20.14■□□□□ 0.81
PUF60-218ENST00000531995 RDH13Q8NBN7 331 aa20.14■□□□□ 0.81
PUF60-218ENST00000531995 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa20.14■□□□□ 0.81
PUF60-218ENST00000531995 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
PUF60-218ENST00000531995 IGSF9Q9P2J2 1179 aa20.14■□□□□ 0.81
PUF60-218ENST00000531995 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa20.14■□□□□ 0.81
PUF60-218ENST00000531995 COL4A3Q01955 1670 aa20.13■□□□□ 0.81
PUF60-218ENST00000531995 CALUO43852 315 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
PUF60-218ENST00000531995 AOC1P19801 751 aa20.13■□□□□ 0.81
PUF60-218ENST00000531995 CASP4P49662 377 aa20.13■□□□□ 0.81
PUF60-218ENST00000531995 SCARA3Q6AZY7 606 aa20.13■□□□□ 0.81
PUF60-218ENST00000531995 JADE1Q6IE81 842 aa20.13■□□□□ 0.81
PUF60-218ENST00000531995 ASCL5Q7RTU5 278 aa20.13■□□□□ 0.81
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