RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514596.1

CTBP1-215, Transcript of C-terminal binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTBP1, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1-215ENST00000514596 VN1R3Q9BXE9 311 aa20.28■□□□□ 0.84
CTBP1-215ENST00000514596 PCIF1Q9H4Z3 704 aa20.28■□□□□ 0.84
CTBP1-215ENST00000514596 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa20.28■□□□□ 0.84
CTBP1-215ENST00000514596 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CTBP1-215ENST00000514596 C2CD2Q9Y426 696 aa20.28■□□□□ 0.84
CTBP1-215ENST00000514596 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa20.28■□□□□ 0.84
CTBP1-215ENST00000514596 DENND4AQ7Z401 1863 aa20.27■□□□□ 0.84
CTBP1-215ENST00000514596 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CTBP1-215ENST00000514596 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CTBP1-215ENST00000514596 PDXKO00764 312 aa20.27■□□□□ 0.84
CTBP1-215ENST00000514596 EFEMP2O95967 443 aa20.27■□□□□ 0.84
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CTBP1-215ENST00000514596 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CTBP1-215ENST00000514596 TMEM132DQ14C87 1099 aa20.27■□□□□ 0.84
CTBP1-215ENST00000514596 UPP1Q16831 310 aa20.27■□□□□ 0.84
CTBP1-215ENST00000514596 JADE1Q6IE81 842 aa20.27■□□□□ 0.84
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CTBP1-215ENST00000514596 BEST2Q8NFU1 509 aa20.27■□□□□ 0.84
CTBP1-215ENST00000514596 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
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CTBP1-215ENST00000514596 ZNF233A6NK53 670 aa20.26■□□□□ 0.83
CTBP1-215ENST00000514596 SPDYE4A6NLX3 237 aa20.26■□□□□ 0.83
CTBP1-215ENST00000514596 GOLGA8JA6NMD2 632 aa20.26■□□□□ 0.83
CTBP1-215ENST00000514596 F8W810 466 aa20.26■□□□□ 0.83
CTBP1-215ENST00000514596 PODXLO00592 558 aa20.26■□□□□ 0.83
CTBP1-215ENST00000514596 TADA2AO75478 443 aa20.26■□□□□ 0.83
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CTBP1-215ENST00000514596 NPR3P17342 541 aa20.26■□□□□ 0.83
CTBP1-215ENST00000514596 LRPAP1P30533 357 aa20.26■□□□□ 0.83
CTBP1-215ENST00000514596 CYP2J2P51589 502 aa20.26■□□□□ 0.83
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CTBP1-215ENST00000514596 ZBTB6Q15916 424 aa20.26■□□□□ 0.83
CTBP1-215ENST00000514596 COBLL1Q53SF7 1204 aa20.26■□□□□ 0.83
CTBP1-215ENST00000514596 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CTBP1-215ENST00000514596 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa20.26■□□□□ 0.83
CTBP1-215ENST00000514596 XXYLT1Q8NBI6 393 aa20.26■□□□□ 0.83
CTBP1-215ENST00000514596 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CTBP1-215ENST00000514596 TMEM174Q8WUU8 243 aa20.26■□□□□ 0.83
CTBP1-215ENST00000514596 LMBRD1Q9NUN5 540 aa20.26■□□□□ 0.83
CTBP1-215ENST00000514596 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa20.26■□□□□ 0.83
CTBP1-215ENST00000514596 IRAK3Q9Y616 596 aa20.26■□□□□ 0.83
CTBP1-215ENST00000514596 CACNA1BQ00975 2339 aa20.26■□□□□ 0.83
CTBP1-215ENST00000514596 CLIC2O15247 247 aa20.25■□□□□ 0.83
CTBP1-215ENST00000514596 CALUO43852 315 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
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CTBP1-215ENST00000514596 NFICP08651 508 aa20.25■□□□□ 0.83
CTBP1-215ENST00000514596 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP20.25■□□□□ 0.83
CTBP1-215ENST00000514596 SURF1Q15526 300 aa20.25■□□□□ 0.83
CTBP1-215ENST00000514596 SPATA1Q5VX52 437 aa20.25■□□□□ 0.83
CTBP1-215ENST00000514596 TMC5Q6UXY8 1006 aa20.25■□□□□ 0.83
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CTBP1-215ENST00000514596 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa20.25■□□□□ 0.83
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CTBP1-215ENST00000514596 EPCAMP16422 314 aa20.24■□□□□ 0.83
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CTBP1-215ENST00000514596 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CTBP1-215ENST00000514596 NFIL3Q16649 462 aa20.24■□□□□ 0.83
CTBP1-215ENST00000514596 USP41Q3LFD5 358 aa20.24■□□□□ 0.83
CTBP1-215ENST00000514596 KIAA2013Q8IYS2 634 aa20.24■□□□□ 0.83
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CTBP1-215ENST00000514596 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
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CTBP1-215ENST00000514596 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
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CTBP1-215ENST00000514596 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
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CTBP1-215ENST00000514596 EFCAB13Q8IY85 973 aa20.23■□□□□ 0.83
CTBP1-215ENST00000514596 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CTBP1-215ENST00000514596 C3orf58Q8NDZ4 430 aa20.23■□□□□ 0.83
CTBP1-215ENST00000514596 GPR62Q9BZJ7 368 aa20.23■□□□□ 0.83
CTBP1-215ENST00000514596 CLSTN2Q9H4D0 955 aa20.23■□□□□ 0.83
CTBP1-215ENST00000514596 KCNK12Q9HB15 430 aa20.23■□□□□ 0.83
CTBP1-215ENST00000514596 IGSF9Q9P2J2 1179 aa20.23■□□□□ 0.83
CTBP1-215ENST00000514596 MAN1B1Q9UKM7 699 aa20.23■□□□□ 0.83
CTBP1-215ENST00000514596 NR3C1P04150 777 aa20.22■□□□□ 0.83
CTBP1-215ENST00000514596 PAX3P23760 479 aa20.22■□□□□ 0.83
CTBP1-215ENST00000514596 CREMQ03060 361 aa20.22■□□□□ 0.83
CTBP1-215ENST00000514596 PDXDC1Q6P996 788 aa20.22■□□□□ 0.83
CTBP1-215ENST00000514596 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
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