RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514183.5

RACK1-231, Transcript of receptor for activated C kinase 1, human

TSL 2

Gene RACK1, Length 1,439 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RACK1-231	ENST00000514183	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	KCNK12	Q9HB15	430 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	7.26	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	UBE4B	O95155	1302 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183		A0A0U1RQF3	1178 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183		K7ENM7	598 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	PDXK	O00764	312 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	CETN3	O15182	167 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	ZNF862	O60290	1169 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	OFD1	O75665	1012 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	STBD1	O95210	358 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	GNA14	O95837	355 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	GYPC	P04921	128 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	CTSA	P10619	480 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	SRF	P11831	508 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	PLS3	P13797	630 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	NR2F2	P24468	414 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	CASP14	P31944	242 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	GATM	P50440	423 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	RAB27A	P51159	221 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	PRKCE	Q02156	737 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	LMNB2	Q03252	620 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	KCNA1	Q09470	495 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	ADAM9	Q13443	819 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	SYCP1	Q15431	976 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	MAN2A1	Q16706	1144 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	ANO5	Q75V66	913 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	TMEM139	Q8IV31	216 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	CNGA4	Q8IV77	575 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	VPS52	Q8N1B4	723 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	METTL13	Q8N6R0	699 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	CCDC51	Q96ER9	411 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	CEP170P1	Q96L14	293 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	DRC1	Q96MC2	740 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	CASD1	Q96PB1	797 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	PANX2	Q96RD6	677 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	FIZ1	Q96SL8	496 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	NDST4	Q9H3R1	872 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	ZNF302	Q9NR11	478 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	CEP250	Q9BV73	2442 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	DMD	P11532	3685 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	USP27X	A6NNY8	438 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	NCAM2	O15394	837 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	ARHGAP6	O43182	974 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	TGFB1I1	O43294	461 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	NR3C1	P04150	777 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	ASGR2	P07307	311 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	FGFR1	P11362	822 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	KLRC2	P26717	231 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	KLK7	P49862	253 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	BCAR1	P56945	870 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	DSC3	Q14574	896 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	PPP2R5D	Q14738	602 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	XKR3	Q5GH77	459 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	KSR1	Q8IVT5	923 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RACK1-231	ENST00000514183	PGBD4	Q96DM1	585 aa		7.24	□□□□□ -1.25

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