RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SRFP11831 508 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GARTP22102 1010 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GUCY2FP51841 1108 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VCPP55072 806 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HTR4Q13639 388 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C9orf57Q5W0N0 161 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CNNM4Q6P4Q7 775 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SHC4Q6S5L8 630 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 USP37Q86T82 979 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MFSD1Q9H3U5 465 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CFAP45Q9UL16 551 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR6C75A6NL08 312 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SEC24AO95486 1093 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NFICP08651 508 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CASP5P51878 434 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PTPN5P54829 565 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NHLH1Q02575 133 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ADCY1Q08828 1119 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MTSS1LQ765P7 747 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SYCP3Q8IZU3 236 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM130Q8N3G9 435 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRSS33Q8NF86 280 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ITFG1Q8TB96 612 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SENP8Q96LD8 212 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRIM9Q9C026 710 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IKZF4Q9H2S9 585 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FBXL21Q9UKT6 434 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 INSL5Q9Y5Q6 135 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPEF2O14830 753 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NARSO43776 548 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MICAL2O94851 1124 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RHOP08100 348 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CPB1P15086 417 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GPR17Q13304 367 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MYBPC2Q14324 1141 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OVOS1Q6IE37 1185 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAGEF1Q9HAY2 307 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DPP3Q9NY33 737 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GDE1Q9NZC3 331 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NUMBLQ9Y6R0 609 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MYH15Q9Y2K3 1946 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF197O14709 1029 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPTLC1O15269 473 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CYP11A1P05108 521 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ODC1P11926 461 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NPR3P17342 541 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IQCEQ6IPM2 695 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PARM1Q6UWI2 310 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NPAS3Q8IXF0 933 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ELMOD1Q8N336 334 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FGF14Q92915 247 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DHX58Q96C10 678 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C7orf25Q9BPX7 421 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM213AQ9BRX8 229 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RCOR1Q9UKL0 485 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DSEQ9UL01 958 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PCDHA7Q9UN72 937 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NOTCH4Q99466 2003 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PIEZO1Q92508 2521 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KMT2EQ8IZD2 1858 aa18.2■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EXTL3O43909 919 aa18.2■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CFHP08603 1231 aa18.2■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ME1P48163 572 aa18.2■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TAF6P49848 677 aa18.2■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TCF15Q12870 199 aa18.2■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARMCX5Q6P1M9 558 aa18.2■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BRSK2Q8IWQ3 736 aa18.2■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SIX5Q8N196 739 aa18.2■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM105Q8N8V8 129 aa18.2■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LEMD2Q8NC56 503 aa18.2■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RTP3Q9BQQ7 232 aa18.2■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa18.2■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM13BQ9NYF5 915 aa18.2■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HSFX1Q9UBD0 423 aa18.2■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AOC1P19801 751 aa18.19■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PKP1Q13835 747 aa18.19■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC5A9Q2M3M2 681 aa18.19■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRSS36Q5K4E3 855 aa18.19■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CYP4A22Q5TCH4 519 aa18.19■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EFCAB13Q8IY85 973 aa18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms