RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506510.6

PDE4D-215, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4

Gene PDE4D, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-215ENST00000506510 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 TMEM240Q5SV17 173 aa6.06□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 ODR4Q5SWX8 454 aa6.06□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF365Q70YC5 407 aa6.06□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 FAM43AQ8N2R8 423 aa6.06□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 CPA6Q8N4T0 437 aa6.06□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.06□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 BOD1Q96IK1 185 aa6.06□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 KLHL32Q96NJ5 620 aa6.06□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 TOR3AQ9H497 397 aa6.06□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 GALNT9Q9HCQ5 603 aa6.06□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 JKAMPQ9P055 326 aa6.06□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 F2RL2O00254 374 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 DTNBO60941 627 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 SLC43A1O75387 559 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 PDCP20941 246 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 FDXRP22570 491 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 TGM1P22735 817 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 VAV2P52735 878 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 RHBDL3P58872 404 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 FOXI1Q12951 378 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 SNAPC2Q13487 334 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 RALBP1Q15311 655 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 SLC4A10Q6U841 1118 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 CATIPQ7Z7H3 387 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 TMIEQ8NEW7 156 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 Q96MF0 132 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 TMEM74BQ9NUR3 256 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 SEC24CP53992 1094 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 HOOK2Q96ED9 719 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 HSPBAP1Q96EW2 488 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 COQ10AQ96MF6 247 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 MED15Q96RN5 788 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 IMPG2Q9BZV3 1241 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 UBA5Q9GZZ9 404 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 CASS4Q9NQ75 786 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 MAN1C1Q9NR34 630 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 TBCCD1Q9NVR7 557 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 IP6K2Q9UHH9 426 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 LMNAP02545 664 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 BMP5P22003 454 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 PLA2G5P39877 138 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 BLOC1S1P78537 153 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 BIRC2Q13490 618 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 CCDC93Q567U6 631 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 USP45Q70EL2 814 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 Q8NA96 180 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 PDPRQ8NCN5 879 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 C3orf20Q8ND61 904 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 TMEM125Q96AQ2 219 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 RGMAQ96B86 450 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 ZG16BQ96DA0 208 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 SLAMF7Q9NQ25 335 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-215ENST00000506510 ALDH1L1O75891 902 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-215ENST00000506510 FTLP02792 175 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-215ENST00000506510 POU2F2P09086 479 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-215ENST00000506510 TYRP1P17643 537 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-215ENST00000506510 NOGQ13253 232 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-215ENST00000506510 MPP3Q13368 585 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-215ENST00000506510 OLFML1Q6UWY5 402 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-215ENST00000506510 COLGALT2Q8IYK4 626 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-215ENST00000506510 PRR18Q8N4B5 295 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-215ENST00000506510 AOPEPQ8N6M6 819 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-215ENST00000506510 SLC17A8Q8NDX2 589 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-215ENST00000506510 SSH3Q8TE77 659 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-215ENST00000506510 EVI5LQ96CN4 794 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-215ENST00000506510 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-215ENST00000506510 C8orf48Q96LL4 319 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-215ENST00000506510 RPS6KC1Q96S38 1066 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-215ENST00000506510 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-215ENST00000506510 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-215ENST00000506510 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.01□□□□□ -1.45
PDE4D-215ENST00000506510 MYADML2A6NDP7 307 aa6.01□□□□□ -1.45
PDE4D-215ENST00000506510 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
PDE4D-215ENST00000506510 E9PLN8 166 aa6.01□□□□□ -1.45
PDE4D-215ENST00000506510 OVOL3O00110 214 aa6.01□□□□□ -1.45
PDE4D-215ENST00000506510 ESRRBO95718 433 aa6.01□□□□□ -1.45
PDE4D-215ENST00000506510 GNAI3P08754 354 aa6.01□□□□□ -1.45
PDE4D-215ENST00000506510 PF4V1P10720 104 aa6.01□□□□□ -1.45
PDE4D-215ENST00000506510 KCNA2P16389 499 aa6.01□□□□□ -1.45
PDE4D-215ENST00000506510 SMARCA1P28370 1054 aa6.01□□□□□ -1.45
PDE4D-215ENST00000506510 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PDE4D-215ENST00000506510 GNAI1P63096 354 aa6.01□□□□□ -1.45
PDE4D-215ENST00000506510 MC2RQ01718 297 aa6.01□□□□□ -1.45
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF844Q08AG5 666 aa6.01□□□□□ -1.45
PDE4D-215ENST00000506510 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa6.01□□□□□ -1.45
PDE4D-215ENST00000506510 VKORC1Q9BQB6 163 aa6.01□□□□□ -1.45
PDE4D-215ENST00000506510 ABCF2Q9UG63 623 aa6.01□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms