RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM30AQ9NZY2 134 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 JKAMPQ9P055 326 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 CPA4Q9UI42 421 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 PCDHA6Q9UN73 950 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 L1RE1Q9UN81 338 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM50BQ9Y247 325 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 XDHP47989 1333 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 KDM5BQ9UGL1 1544 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 MADDQ8WXG6 1647 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 GRXCR1A8MXD5 290 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 CAND2O75155 1236 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 AGFG2O95081 481 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 MATN4O95460 622 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 GNAI3P08754 354 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF20P17024 532 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 RHCEP18577 417 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 GNAI1P63096 354 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 NOMO3P69849 1222 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 ADAM17P78536 824 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 RHDQ02161 417 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 EFEMP1Q12805 493 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 KIAA0753Q2KHM9 967 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 NOMO2Q5JPE7 1267 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 KSR2Q6VAB6 950 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 ZFPM1Q8IX07 1006 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 TMIEQ8NEW7 156 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 TBC1D15Q8TC07 691 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 TEX101Q9BY14 249 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 C22orf23Q9BZE7 217 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 BHMT2Q9H2M3 363 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 BRD9Q9H8M2 597 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 SORCS3Q9UPU3 1222 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 BCORL1Q5H9F3 1711 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 CCDC78A2IDD5 438 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 CFAP69A5D8W1 941 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 PRSS29PA6NIE9 313 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF785A8K8V0 405 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF185O15231 689 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM20BO75063 409 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 GJB1P08034 283 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 KITP10721 976 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 NPR1P16066 1061 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 HDCP19113 662 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 SOX8P57073 446 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 GPSM2P81274 684 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 SLFN5Q08AF3 891 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 SPDYAQ5MJ70 313 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 RNF220Q5VTB9 566 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 TSHZ3Q63HK5 1081 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 APOA5Q6Q788 366 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 TMPRSS6Q8IU80 811 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 CCDC146Q8IYE0 955 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC17A8Q8NDX2 589 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 IL17DQ8TAD2 202 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 EXTL1Q92935 676 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 TTC17Q96AE7 1141 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 MRGPRX1Q96LB2 322 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 KLHL32Q96NJ5 620 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 ZSWIM1Q9BR11 485 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 SARGQ9BW04 601 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 TLR10Q9BXR5 811 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 CHST2Q9Y4C5 530 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A1W2PPL8 197 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 AHRRA9YTQ3 701 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 E9PLN8 166 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 PLSCR1O15162 318 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 RPS6KA4O75676 772 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 HRGP04196 525 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 KRT18P05783 430 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 CKBP12277 381 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 FCER1AP12319 257 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 TRIM27P14373 513 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 GCSHP23434 173 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 CACNB3P54284 484 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 KRTAP10-2P60368 255 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM193AP78312 1265 aa4.09□□□□□ -1.75
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