RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481655.2

CTCFL-210, Transcript of CCCTC-binding factor like, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 1,512 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFL-210ENST00000481655 RASIP1Q5U651 963 aa16.01■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa16.01■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 RRAGAQ7L523 313 aa16.01■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 CPLX3Q8WVH0 158 aa16.01■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 STK33Q9BYT3 514 aa16.01■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 DNAI2Q9GZS0 605 aa16.01■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa16.01■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 CYP3A43Q9HB55 503 aa16.01■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 AAASQ9NRG9 546 aa16.01■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 MYO6Q9UM54 1294 aa16.01■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 CAPN11Q9UMQ6 739 aa16.01■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 FAN1Q9Y2M0 1017 aa16.01■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 SNX9Q9Y5X1 595 aa16.01■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 FHOD1Q9Y613 1164 aa16.01■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 H0YGN5 161 aa16■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa16■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 NOL4O94818 638 aa16■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 GYPCP04921 128 aa16■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 LAG3P18627 525 aa16■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 ZBED6P86452 979 aa16■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 IQCEQ6IPM2 695 aa16■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 SPOPLQ6IQ16 392 aa16■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 DSTYKQ6XUX3 929 aa16■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 FIBCD1Q8N539 461 aa16■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 TATDN2Q93075 761 aa16■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 MMS19Q96T76 1030 aa16■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 TTYH3Q9C0H2 523 aa16■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 NLRC4Q9NPP4 1024 aa16■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 GDAP2Q9NXN4 497 aa16■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 PPEF2O14830 753 aa15.99■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 HUS1O60921 280 aa15.99■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 LRRN2O75325 713 aa15.99■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 TADA2AO75478 443 aa15.99■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 PTMAP06454 111 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 CCDC172P0C7W6 258 aa15.99■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 CASP14P31944 242 aa15.99■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 APBA1Q02410 837 aa15.99■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 ARHGAP44Q17R89 818 aa15.99■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 DPH6Q7L8W6 267 aa15.99■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 ARHGEF19Q8IW93 802 aa15.99■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 APPL2Q8NEU8 664 aa15.99■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 PDLIM2Q96JY6 352 aa15.99■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 ZNF558Q96NG5 402 aa15.99■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 PAAF1Q9BRP4 392 aa15.99■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 DNAJB4Q9UDY4 337 aa15.99■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 DSEQ9UL01 958 aa15.99■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 ANK1P16157 1881 aa15.99■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 NRP1O14786 923 aa15.99■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 EPHB6O15197 1021 aa15.99■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 MFAP3LO75121 409 aa15.99■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 GALTP07902 379 aa15.99■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 ODC1P11926 461 aa15.99■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 KRT9P35527 623 aa15.99■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 STAT1P42224 750 aa15.99■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 BCAR1P56945 870 aa15.99■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 C9orf50Q5SZB4 431 aa15.99■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 GJB7Q6PEY0 223 aa15.99■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa15.99■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 TOP6BLQ8N6T0 577 aa15.99■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 GDF15Q99988 308 aa15.99■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 CACNG4Q9UBN1 327 aa15.99■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 CYB561D2O14569 222 aa15.98■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 NRDCO43847 1150 aa15.98■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 KIF4AO95239 1232 aa15.98■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 FAM163BP0C2L3 166 aa15.98■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 PPM1AP35813 382 aa15.98■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 ASPAP45381 313 aa15.98■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 SLC11A1P49279 550 aa15.98■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 SHHQ15465 462 aa15.98■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa15.98■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 METTL23Q86XA0 190 aa15.98■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 TMEM86AQ8N2M4 240 aa15.98■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 TMEM130Q8N3G9 435 aa15.98■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 OR8K1Q8NGG5 319 aa15.98■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 SENP8Q96LD8 212 aa15.98■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 KREMEN1Q96MU8 473 aa15.98■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 BCO2Q9BYV7 579 aa15.98■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 STK39Q9UEW8 545 aa15.98■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 ADAM28Q9UKQ2 775 aa15.98■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa15.98■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 F8VZ95 297 aa15.97■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 SPTLC1O15269 473 aa15.97■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 B4GALT3O60512 393 aa15.97■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 USP8P40818 1118 aa15.97■□□□□ 0.15
CTCFL-210ENST00000481655 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.152e-8■□□□□ 9.7
CTCFL-210ENST00000481655 JAM2P57087 298 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 6.7 ms