RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480381.1

RYK-204, Transcript of receptor-like tyrosine kinase, human

TSL 5

Gene RYK, Length 541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RYK-204	ENST00000480381	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	SLC35A4	Q96G79	324 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	WDCP	Q9H6R7	721 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	SPDEF	O95238	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	GJB1	P08034	283 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	HDC	P19113	662 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	HTR1B	P28222	390 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	PIK3CG	P48736	1102 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	USP14	P54578	494 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	RAB1A	P62820	205 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	REST	Q13127	1097 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	CYP2A13	Q16696	494 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	EMC10	Q5UCC4	262 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	NPNT	Q6UXI9	565 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	PDPR	Q8NCN5	879 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	HAS1	Q92839	578 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	BOD1	Q96IK1	185 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	FAM167A	Q96KS9	214 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	RLIM	Q9NVW2	624 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	ETAA1	Q9NY74	926 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	DNAJB5	O75953	348 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	ZNF202	O95125	648 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	LAG3	P18627	525 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	FDXR	P22570	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	SMARCA1	P28370	1054 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	IL12RB1	P42701	662 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	CXADR	P78310	365 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	TP53BP2	Q13625	1128 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	GBX1	Q14549	363 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	GRM3	Q14832	879 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	ATP2B3	Q16720	1220 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	PCSK4	Q6UW60	755 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	SCAMP4	Q969E2	229 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	PNKP	Q96T60	521 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	ARMT1	Q9H993	441 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	OBP2A	Q9NY56	170 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	UNC119B	A6NIH7	251 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	VSTM5	A8MXK1	200 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381		H3BUI4	141 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	SUN1	O94901	812 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	GPANK1	O95872	356 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	SLPI	P03973	132 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	ANXA1	P04083	346 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	PTGS2	P35354	604 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	ARFIP2	P53365	341 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	KLF10	Q13118	480 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	GPR149	Q86SP6	731 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	VRK3	Q8IV63	474 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	POC1B	Q8TC44	478 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	ASB10	Q8WXI3	467 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	BRD9	Q9H8M2	597 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	SYBU	Q9NX95	663 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	STAP2	Q9UGK3	403 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	L1RE1	Q9UN81	338 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381		A0A1W2PS29	197 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RYK-204	ENST00000480381	ERC2	O15083	957 aa		4.85	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms