RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480054.1

RABGAP1-210, Transcript of RAB GTPase activating protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGAP1, Length 423 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGAP1-210ENST00000480054 MATN2O00339 956 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 NOBOXO60393 691 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 FPR1P21462 350 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 NPEPPSP55786 919 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 PTH1RQ03431 593 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 BORAQ6PGQ7 559 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 SEM1Q6ZVN7 128 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 DPP9Q86TI2 863 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 FAM186BQ8IYM0 893 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 IL17RDQ8NFM7 739 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 MDM1Q8TC05 714 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 RAB24Q969Q5 203 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 SUCLG2Q96I99 432 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 KCNH6Q9H252 994 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 LDAHQ9H6V9 325 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 ARMT1Q9H993 441 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 ACTL7AQ9Y615 435 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 IQGAP1P46940 1657 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 METP08581 1390 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 A0A1W2PPL8 197 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 F2RL2O00254 374 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 B4GALT3O60512 393 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 B4GALT4O60513 344 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 RAC3P60763 192 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 MFSD14BQ5SR56 506 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 FRMD5Q7Z6J6 570 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 NT5C1BQ96P26 610 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 FMNL2Q96PY5 1086 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 POLR3GLQ9BT43 218 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 NELFAQ9H3P2 528 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 TAGLN3Q9UI15 199 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 LTBP4Q8N2S1 1624 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 PIK3C2GO75747 1445 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 B5MCH6 92 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 WNT10BO00744 389 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 PAX4O43316 350 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 ALDH1A3P47895 512 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 KCNC1P48547 511 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 RIN1Q13671 783 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 ACAP1Q15027 740 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 SURF1Q15526 300 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 AFMIDQ63HM1 303 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 SRLQ86TD4 932 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 CERS3Q8IU89 383 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 LGI4Q8N135 537 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 SHCBP1Q8NEM2 672 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 STON2Q8WXE9 905 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 CEP95Q96GE4 821 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 MRGPRX1Q96LB2 322 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 CNNM1Q9NRU3 951 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 RTEL1Q9NZ71 1219 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 PPLO60437 1756 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 MYOM2P54296 1465 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGAP1-210ENST00000480054 PTPRUQ92729 1446 aa6.84□□□□□ -1.32
RABGAP1-210ENST00000480054 PIK3R4Q99570 1358 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGAP1-210ENST00000480054 CLSPNQ9HAW4 1339 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGAP1-210ENST00000480054 UBE2QL1A1L167 161 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGAP1-210ENST00000480054 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
RABGAP1-210ENST00000480054 NUAK1O60285 661 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGAP1-210ENST00000480054 SERPINB3P29508 390 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGAP1-210ENST00000480054 PIK3CBP42338 1070 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGAP1-210ENST00000480054 CASP5P51878 434 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGAP1-210ENST00000480054 ARFIP2P53365 341 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGAP1-210ENST00000480054 BTKQ06187 659 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGAP1-210ENST00000480054 KRT72Q14CN4 511 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGAP1-210ENST00000480054 PKN1Q16512 942 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGAP1-210ENST00000480054 LONRF1Q17RB8 773 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGAP1-210ENST00000480054 CIAPIN1Q6FI81 312 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGAP1-210ENST00000480054 PPP1R3BQ86XI6 285 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGAP1-210ENST00000480054 SH2D3CQ8N5H7 860 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGAP1-210ENST00000480054 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
RABGAP1-210ENST00000480054 PARD3BQ8TEW8 1205 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGAP1-210ENST00000480054 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGAP1-210ENST00000480054 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
RABGAP1-210ENST00000480054 MSLNLQ96KJ4 702 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGAP1-210ENST00000480054 CCDC138Q96M89 665 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGAP1-210ENST00000480054 TBCBQ99426 244 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGAP1-210ENST00000480054 TCF25Q9BQ70 676 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGAP1-210ENST00000480054 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
RABGAP1-210ENST00000480054 KIAA1586Q9HCI6 787 aa6.83□□□□□ -1.32
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