RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466405.1

WDR48-208, Transcript of WD repeat domain 48, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene WDR48, Length 4,925 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR48-208ENST00000466405 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa6.89□□□□□ -1.31
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WDR48-208ENST00000466405 TCP10LQ8TDR4 215 aa6.88□□□□□ -1.31
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