RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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USP54-210ENST00000466048 TMEM39AQ9NV64 488 aa8.13□□□□□ -1.11
USP54-210ENST00000466048 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
USP54-210ENST00000466048 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa8.13□□□□□ -1.11
USP54-210ENST00000466048 EMSYQ7Z589 1322 aa8.13□□□□□ -1.11
USP54-210ENST00000466048 GRID2IPA4D2P6 1211 aa8.12□□□□□ -1.11
USP54-210ENST00000466048 STK10O94804 968 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
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USP54-210ENST00000466048 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
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USP54-210ENST00000466048 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
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USP54-210ENST00000466048 IRAK4Q9NWZ3 460 aa8.12□□□□□ -1.11
USP54-210ENST00000466048 LOC285556D6RIA3 1793 aa8.12□□□□□ -1.11
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USP54-210ENST00000466048 CRYMQ14894 314 aa8.12□□□□□ -1.11
USP54-210ENST00000466048 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
USP54-210ENST00000466048 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
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USP54-210ENST00000466048 USP20Q9Y2K6 914 aa8.12□□□□□ -1.11
USP54-210ENST00000466048 SCINQ9Y6U3 715 aa8.12□□□□□ -1.11
USP54-210ENST00000466048 SBF1O95248 1867 aa8.12□□□□□ -1.11
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USP54-210ENST00000466048 MOXD2PA6NHM9 499 aa8.12□□□□□ -1.11
USP54-210ENST00000466048 CES2O00748 559 aa8.12□□□□□ -1.11
USP54-210ENST00000466048 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
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USP54-210ENST00000466048 ZBTB33Q86T24 672 aa8.12□□□□□ -1.11
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USP54-210ENST00000466048 PORCNQ9H237 461 aa8.12□□□□□ -1.11
USP54-210ENST00000466048 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
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USP54-210ENST00000466048 Q9Y3F1 56 aa8.12□□□□□ -1.11
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USP54-210ENST00000466048 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa8.11□□□□□ -1.11
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USP54-210ENST00000466048 SRRDQ9UH36 339 aa8.11□□□□□ -1.11
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USP54-210ENST00000466048 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
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USP54-210ENST00000466048 TRIM49CP0CI26 452 aa8.11□□□□□ -1.11
USP54-210ENST00000466048 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
USP54-210ENST00000466048 HSPA6P17066 643 aa8.11□□□□□ -1.11
USP54-210ENST00000466048 THPOP40225 353 aa8.11□□□□□ -1.11
USP54-210ENST00000466048 HADHQ16836 314 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
USP54-210ENST00000466048 NUDT18Q6ZVK8 323 aa8.11□□□□□ -1.11
USP54-210ENST00000466048 THNSL1Q8IYQ7 743 aa8.11□□□□□ -1.11
USP54-210ENST00000466048 FBXL13Q8NEE6 735 aa8.11□□□□□ -1.11
USP54-210ENST00000466048 MORC4Q8TE76 937 aa8.11□□□□□ -1.11
USP54-210ENST00000466048 SPDL1Q96EA4 605 aa8.11□□□□□ -1.11
USP54-210ENST00000466048 TNIP3Q96KP6 325 aa8.11□□□□□ -1.11
USP54-210ENST00000466048 MFSD14AQ96MC6 490 aa8.11□□□□□ -1.11
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