RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 IL17BQ9UHF5 180 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 KANSL1LA0AUZ9 987 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 GREM1O60565 184 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 STAT3P40763 770 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 CPT1AP50416 773 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 ADCY1Q08828 1119 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 PTPN14Q15678 1187 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 ATAT1Q5SQI0 421 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 PLPP4Q5VZY2 271 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 TCEAL6Q6IPX3 200 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 KIAA1841Q6NSI8 718 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 CEP68Q76N32 757 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 NAT16Q8N8M0 369 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM52Q8NDY8 209 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 CASP10Q92851 521 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 TCEAL3Q969E4 200 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 SHDQ96IW2 340 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 CFAP53Q96M91 514 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 KLHL5Q96PQ7 755 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 CTAGE1Q96RT6 745 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 GPR20Q99678 358 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 COPRSQ9NQ92 184 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 PDGFCQ9NRA1 345 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 KIAA1671Q9BY89 1806 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 EMSYQ7Z589 1322 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 A0A1W2PQJ5 194 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 INSRRP14616 1297 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 RDXP35241 583 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 COPB2P35606 906 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 MAGEA9P43362 315 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 CASP7P55210 303 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 STARD6P59095 220 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 MVKQ03426 396 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 RBL2Q08999 1139 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 AUHQ13825 339 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 PPP2R5DQ14738 602 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 METTL24Q5JXM2 366 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 CRTC3Q6UUV7 619 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 LMBR1LQ6UX01 489 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 GK5Q6ZS86 529 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 CCDC149Q6ZUS6 474 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 EEPD1Q7L9B9 569 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 JAMLQ86YT9 394 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC44A3Q8N4M1 653 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 RASGRP4Q8TDF6 673 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 SEPT8Q92599 483 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 FGD4Q96M96 766 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC6A18Q96N87 628 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 DSCC1Q9BVC3 393 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 TRAIPQ9BWF2 469 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 BABAM1Q9NWV8 329 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 SUSD2Q9UGT4 822 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 Q9Y3F1 56 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 SALL3Q9BXA9 1300 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 CSMD1Q96PZ7 3565 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 A0A087WV48 116 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 PI4KAP2A4QPH2 592 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 GSNP06396 782 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 GSTM1P09488 218 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 HOXB7P09629 217 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 TDGF1P13385 188 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 NME1P15531 152 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 CD72P21854 359 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 MCM4P33991 863 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 FOXO4P98177 505 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 CLCQ05315 142 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 MTAPQ13126 283 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 SEZ6Q53EL9 994 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 UBXN11Q5T124 520 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 IQSEC1Q6DN90 963 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 PAQR3Q6TCH7 311 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-203ENST00000459697 TEX11Q8IYF3 940 aa5.66□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms