RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442312.6

SH3BP2-203, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-203ENST00000442312 IMPAD1Q9NX62 359 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 ARIH2O95376 493 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 MCAMP43121 646 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 MAGEA4P43358 317 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 GPC3P51654 580 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 SPICE1Q8N0Z3 855 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 OR6P1Q8NGX9 317 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 SP110Q9HB58 689 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 PCMTD2Q9NV79 361 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 USP32Q8NFA0 1604 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 CNTFP26441 200 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 ADSSL1Q8N142 457 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 GPD1LQ8N335 351 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 PTPRN2Q92932 1015 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 ATP6V1G2O95670 118 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 TRIM51Q9BSJ1 452 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 UNC45AQ9H3U1 944 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 UCHL3P15374 230 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 KCNA6P17658 529 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 FMO5P49326 533 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 SLC10A5Q5PT55 438 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 LINC00523Q86TU6 105 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 THEM5Q8N1Q8 247 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 CDK8P49336 464 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 TAB1Q15750 504 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 ZNF197O14709 1029 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 NBNO60934 754 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 SLC29A2Q14542 456 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 NDUFA5Q16718 116 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 ZNF786Q8N393 782 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 TMEM2Q9UHN6 1383 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 PDZK1P1A8MUH7 402 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 DUOXA2Q1HG44 320 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 LRRC6Q86X45 466 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 COA7Q96BR5 231 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 USE1Q9NZ43 259 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 RNF103O00237 685 aa13.08□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 KRT6BP04259 564 aa13.08□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 FAM58BPP0C7Q3 252 aa13.08□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 RGS2P41220 211 aa13.08□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 KRT6CP48668 564 aa13.08□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 NCF4Q15080 339 aa13.08□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa13.08□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 APOL4Q9BPW4 351 aa13.08□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 PAGR1Q9BTK6 254 aa13.08□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 TAGLN3Q9UI15 199 aa13.08□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 MYH1P12882 1939 aa13.08□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 MYH2Q9UKX2 1941 aa13.08□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 MYH4Q9Y623 1939 aa13.08□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 TTKP33981 857 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-203ENST00000442312 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-203ENST00000442312 GGA2Q9UJY4 613 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-203ENST00000442312 SPDYCQ5MJ68 293 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-203ENST00000442312 RAB42Q8N4Z0 105 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-203ENST00000442312 KRT20P35900 424 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-203ENST00000442312 KRT33BQ14525 404 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-203ENST00000442312 ZBTB33Q86T24 672 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-203ENST00000442312 CCNJLQ8IV13 435 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-203ENST00000442312 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-203ENST00000442312 TMEM161AQ9NX61 479 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-203ENST00000442312 HSPBP1Q9NZL4 362 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-203ENST00000442312 ABCA6Q8N139 1617 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-203ENST00000442312 H7C0S8 307 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-203ENST00000442312 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-203ENST00000442312 C4orf33Q8N1A6 199 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-203ENST00000442312 WNK4Q96J92 1243 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-203ENST00000442312 RAD21L1Q9H4I0 556 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-203ENST00000442312 MYO1GB0I1T2 1018 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-203ENST00000442312 THRAP10827 490 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-203ENST00000442312 SERPINB8P50452 374 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-203ENST00000442312 SEC24CP53992 1094 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-203ENST00000442312 TSPY1Q01534 308 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-203ENST00000442312 PRMT9Q6P2P2 845 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-203ENST00000442312 EFCAB1Q9HAE3 211 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-203ENST00000442312 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-203ENST00000442312 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-203ENST00000442312 ANKS3Q6ZW76 656 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-203ENST00000442312 BEST2Q8NFU1 509 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-203ENST00000442312 LRRC39Q96DD0 335 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-203ENST00000442312 PNKPQ96T60 521 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-203ENST00000442312 POTEFA5A3E0 1075 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-203ENST00000442312 POTEIP0CG38 1075 aa13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms