RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375150.6

PRRT1-202, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,726 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-202ENST00000375150 FGFR1P11362 822 aa20.28■□□□□ 0.84
PRRT1-202ENST00000375150 RPL9P32969 192 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PRRT1-202ENST00000375150 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PRRT1-202ENST00000375150 TNNC1P63316 161 aa20.28■□□□□ 0.84
PRRT1-202ENST00000375150 SMYD5Q6GMV2 418 aa20.28■□□□□ 0.84
PRRT1-202ENST00000375150 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PRRT1-202ENST00000375150 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
PRRT1-202ENST00000375150 USP8P40818 1118 aa20.27■□□□□ 0.84
PRRT1-202ENST00000375150 ASPAP45381 313 aa20.27■□□□□ 0.84
PRRT1-202ENST00000375150 KLHL30Q0D2K2 578 aa20.27■□□□□ 0.84
PRRT1-202ENST00000375150 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.845e-8■■■■■ 31.2
PRRT1-202ENST00000375150 TUSC3Q13454 348 aa20.27■□□□□ 0.84
PRRT1-202ENST00000375150 SV2CQ496J9 727 aa20.27■□□□□ 0.84
PRRT1-202ENST00000375150 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PRRT1-202ENST00000375150 FAM71AQ8IYT1 594 aa20.27■□□□□ 0.84
PRRT1-202ENST00000375150 UROC1Q96N76 676 aa20.27■□□□□ 0.84
PRRT1-202ENST00000375150 IL23AQ9NPF7 189 aa20.27■□□□□ 0.84
PRRT1-202ENST00000375150 PPEF2O14830 753 aa20.27■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 EVI5O60447 810 aa20.27■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 TAF6P49848 677 aa20.27■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa20.27■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa20.27■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 BCO2Q9BYV7 579 aa20.27■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 CYP3A43Q9HB55 503 aa20.27■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 POLIQ9UNA4 740 aa20.27■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 BAIAP3O94812 1187 aa20.26■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 KRT5P13647 590 aa20.26■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 PRKCIP41743 596 aa20.26■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 FPGSQ05932 587 aa20.26■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 HGSNATQ68CP4 663 aa20.26■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 GPIHBP1Q8IV16 184 aa20.26■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 CRIPAKQ8N1N5 446 aa20.26■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 CHP1Q99653 195 aa20.26■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa20.26■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 SOWAHDA6NJG2 315 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 PODXLO00592 558 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 AMHP03971 560 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 ACO1P21399 889 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 CCDC170Q8IYT3 715 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 TTC39CQ8N584 583 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 CCDC42Q96M95 316 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 DEF6Q9H4E7 631 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 TBC1D13Q9NVG8 400 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 CASTOR2A6NHX0 329 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 KPNA7A9QM74 516 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 CLCNKBP51801 687 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 BADQ92934 168 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 MMS19Q96T76 1030 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 SMYD3Q9H7B4 428 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 CISHQ9NSE2 258 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 GDAP2Q9NXN4 497 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 SNX9Q9Y5X1 595 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 WEE2P0C1S8 567 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 ACRP10323 421 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 CD58P19256 250 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 KCNJ6P48051 423 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 BPIFB4P59827 614 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 LILRA4P59901 499 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 UPP1Q16831 310 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 TMEM270Q6UE05 265 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 VPS36Q86VN1 386 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 UBR7Q8N806 425 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 CASD1Q96PB1 797 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 HAUS4Q9H6D7 363 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 CNTN6Q9UQ52 1028 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 CYP26A1O43174 497 aa20.23■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 PAX3P23760 479 aa20.23■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 ANXA13P27216 316 aa20.23■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 DSC1Q08554 894 aa20.23■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 PYCARDQ9ULZ3 195 aa20.23■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 CCDC85CA6NKD9 419 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 AKR1B10O60218 316 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 UPP2O95045 317 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 CLCN1P35523 988 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 PDE6CP51160 858 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 WDR5P61964 334 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 PTK2Q05397 1052 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 RAD9BQ6WBX8 426 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 ZSCAN30Q86W11 494 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 CACNG4Q9UBN1 327 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 TBKBP1A7MCY6 615 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 SPTLC1O15269 473 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRT1-202ENST00000375150 HUS1O60921 280 aa20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.3 ms