RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329151.5

TMEM54-201, Transcript of transmembrane protein 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM54, Length 871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54-201ENST00000329151 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
TMEM54-201ENST00000329151 GRM2Q14416 872 aa25.35■■□□□ 1.65
TMEM54-201ENST00000329151 PRSS36Q5K4E3 855 aa25.35■■□□□ 1.65
TMEM54-201ENST00000329151 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
TMEM54-201ENST00000329151 BEST2Q8NFU1 509 aa25.35■■□□□ 1.65
TMEM54-201ENST00000329151 IRF7Q92985 503 aa25.35■■□□□ 1.65
TMEM54-201ENST00000329151 TCEAL4Q96EI5 215 aa25.35■■□□□ 1.65
TMEM54-201ENST00000329151 BORCS6Q96GS4 357 aa25.35■■□□□ 1.65
TMEM54-201ENST00000329151 TSPAN18Q96SJ8 248 aa25.35■■□□□ 1.65
TMEM54-201ENST00000329151 REEP2Q9BRK0 252 aa25.35■■□□□ 1.65
TMEM54-201ENST00000329151 HEBP1Q9NRV9 189 aa25.35■■□□□ 1.65
TMEM54-201ENST00000329151 F5P12259 2224 aa25.35■■□□□ 1.65
TMEM54-201ENST00000329151 OGTO15294 1046 aa25.34■■□□□ 1.65
TMEM54-201ENST00000329151 LRPAP1P30533 357 aa25.34■■□□□ 1.65
TMEM54-201ENST00000329151 ALDH1A3P47895 512 aa25.34■■□□□ 1.65
TMEM54-201ENST00000329151 EPHB3P54753 998 aa25.34■■□□□ 1.65
TMEM54-201ENST00000329151 ZNF528Q3MIS6 628 aa25.34■■□□□ 1.65
TMEM54-201ENST00000329151 FAM78AQ5JUQ0 283 aa25.34■■□□□ 1.65
TMEM54-201ENST00000329151 ARMCX5Q6P1M9 558 aa25.34■■□□□ 1.65
TMEM54-201ENST00000329151 YAF2Q8IY57 180 aa25.34■■□□□ 1.65
TMEM54-201ENST00000329151 RUBCNQ92622 972 aa25.34■■□□□ 1.65
TMEM54-201ENST00000329151 SMARCD2Q92925 531 aa25.34■■□□□ 1.65
TMEM54-201ENST00000329151 MSTO1Q9BUK6 570 aa25.34■■□□□ 1.65
TMEM54-201ENST00000329151 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa25.34■■□□□ 1.65
TMEM54-201ENST00000329151 TBX20Q9UMR3 447 aa25.34■■□□□ 1.65
TMEM54-201ENST00000329151 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
TMEM54-201ENST00000329151 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
TMEM54-201ENST00000329151 TTC26A0AVF1 554 aa25.33■■□□□ 1.65
TMEM54-201ENST00000329151 OR6C75A6NL08 312 aa25.33■■□□□ 1.65
TMEM54-201ENST00000329151 LACTBL1A8MY62 500 aa25.33■■□□□ 1.65
TMEM54-201ENST00000329151 M0QZQ0 153 aa25.33■■□□□ 1.65
TMEM54-201ENST00000329151 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa25.33■■□□□ 1.65
TMEM54-201ENST00000329151 ERMP1Q7Z2K6 904 aa25.33■■□□□ 1.65
TMEM54-201ENST00000329151 CD302Q8IX05 232 aa25.33■■□□□ 1.65
TMEM54-201ENST00000329151 KIAA2013Q8IYS2 634 aa25.33■■□□□ 1.65
TMEM54-201ENST00000329151 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
TMEM54-201ENST00000329151 ASB16Q96NS5 453 aa25.33■■□□□ 1.65
TMEM54-201ENST00000329151 PGLYRP2Q96PD5 576 aa25.33■■□□□ 1.65
TMEM54-201ENST00000329151 GPR88Q9GZN0 384 aa25.33■■□□□ 1.65
TMEM54-201ENST00000329151 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
TMEM54-201ENST00000329151 YIPF1Q9Y548 306 aa25.33■■□□□ 1.65
TMEM54-201ENST00000329151 SPTLC1O15269 473 aa25.32■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 TRAK2O60296 914 aa25.32■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 ODC1P11926 461 aa25.32■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 PSMC3P17980 439 aa25.32■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 TARSP26639 723 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 GDI1P31150 447 aa25.32■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 TNFSF9P41273 254 aa25.32■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 PPP2R5DQ14738 602 aa25.32■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 ARSHQ5FYA8 562 aa25.32■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 OVOS1Q6IE37 1185 aa25.32■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 HS6ST3Q8IZP7 471 aa25.32■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa25.32■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 NCDNQ9UBB6 729 aa25.32■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa25.31■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 OAZ2O95190 189 aa25.31■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 PAX3P23760 479 aa25.31■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 LONP1P36776 959 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 BRAPQ7Z569 592 aa25.31■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 E2F7Q96AV8 911 aa25.31■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 CEP72Q9P209 647 aa25.31■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa25.31■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 COL4A3Q01955 1670 aa25.31■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa25.31■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 TCHHQ07283 1943 aa25.3■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 ZNF263O14978 683 aa25.3■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 PLCG1P19174 1290 aa25.3■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 CCR2P41597 374 aa25.3■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 RPS9P46781 194 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa25.3■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 HAPLN2Q9GZV7 340 aa25.3■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 OR4Q2P0C623 313 aa25.29■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 GJA1P17302 382 aa25.29■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 TYMPP19971 482 aa25.29■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 FCARP24071 287 aa25.29■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 GUCY2FP51841 1108 aa25.29■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 DUSP4Q13115 394 aa25.29■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 MCM6Q14566 821 aa25.29■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 TMEM132DQ14C87 1099 aa25.29■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 KARSQ15046 597 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 TEAD2Q15562 447 aa25.29■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 FAM200AQ8TCP9 573 aa25.29■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 RAD54LQ92698 747 aa25.29■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 CLDN23Q96B33 292 aa25.29■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 ANK1P16157 1881 aa25.28■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 DPYSL4O14531 572 aa25.28■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 PIGRP01833 764 aa25.28■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 GPR17Q13304 367 aa25.28■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 MYBPC2Q14324 1141 aa25.28■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 ZBTB6Q15916 424 aa25.28■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 TAF12Q16514 161 aa25.28■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 JADE1Q6IE81 842 aa25.28■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 SLFN12LQ6IEE8 588 aa25.28■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 ITIH5Q86UX2 942 aa25.28■■□□□ 1.64
TMEM54-201ENST00000329151 METTL23Q86XA0 190 aa25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms