RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222753.5

HOXA13-201, Transcript of homeobox A13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA13, Length 5,030 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13-201ENST00000222753 ADGRB1O14514 1584 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 ERFP50548 548 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF844Q08AG5 666 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 FBXO33Q7Z6M2 555 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 TEX2Q8IWB9 1127 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 RSAD1Q9HA92 442 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 HEY2Q9UBP5 337 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 C1orf167Q5SNV9 1468 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 GJB7Q6PEY0 223 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 CD302Q8IX05 232 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 SLIT1O75093 1534 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 KCNQ2O43526 872 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 STILQ15468 1287 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 TMC3Q7Z5M5 1100 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 PGM2Q96G03 612 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 JMJD4Q9H9V9 463 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 PCMTD2Q9NV79 361 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 MYO3BQ8WXR4 1341 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 TRAPPC3O43617 180 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 PTPN4P29074 926 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 SERPINB10P48595 397 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 ZCWPW2Q504Y3 356 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 WASHC2DQ5SRD0 308 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 FUKQ8N0W3 1084 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 HDAC7Q8WUI4 952 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 KIF9Q9HAQ2 790 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 RNF146Q9NTX7 359 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 AFF2P51816 1311 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 MOXD1Q6UVY6 613 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 C4orf50Q6ZRC1 276 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 LDHDQ86WU2 507 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 CATSPER3Q86XQ3 398 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 FEZF2Q8TBJ5 459 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 RIT2Q99578 217 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 C15orf41Q9Y2V0 281 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 CALB2P22676 271 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 PRUNE1Q86TP1 453 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 ATP8B4Q8TF62 1192 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 MCEEQ96PE7 176 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 COPAP53621 1224 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 ADRM1Q16186 407 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 UGP2Q16851 508 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 PID1Q7Z2X4 250 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 SYF2O95926 243 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 RBP3P10745 1247 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF662Q6ZS27 426 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 DDI1Q8WTU0 396 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 CCDC90BQ9GZT6 254 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 ERVK-9P63128 1117 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 C16orf96A6NNT2 1141 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 BEST2Q8NFU1 509 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 SLC24A2Q9UI40 661 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 PKN1Q16512 942 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 KYAT1Q16773 422 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 C11orf63Q6NUN7 778 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 NDUFAF2Q8N183 169 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 CST8O60676 142 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 SNX2O60749 519 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 ZBTB10Q96DT7 871 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 VPS33BQ9H267 617 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 ESRRBO95718 433 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 NCOA4Q13772 614 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 SLC37A4O43826 429 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 PMS1P54277 932 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 EEPD1Q7L9B9 569 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 STIP1P31948 543 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 SPRP35270 261 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 NEK2P51955 445 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 CHI3L2Q15782 390 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXA13-201ENST00000222753 CATSPER4Q7RTX7 472 aa19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms