RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 TESK2Q96S53 571 aa10.08□□□□□ -0.8
CAPNS1-202ENST00000586851 PLA2R1Q13018 1463 aa10.08□□□□□ -0.8
CAPNS1-202ENST00000586851 TET3O43151 1660 aa10.08□□□□□ -0.8
CAPNS1-202ENST00000586851 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa10.07□□□□□ -0.8
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM161AQ3B820 660 aa10.07□□□□□ -0.8
CAPNS1-202ENST00000586851 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
CAPNS1-202ENST00000586851 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP10.07□□□□□ -0.86e-24■■□□□ 13.8
CAPNS1-202ENST00000586851 MYOM2P54296 1465 aa10.06□□□□□ -0.8
CAPNS1-202ENST00000586851 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa10.06□□□□□ -0.8
CAPNS1-202ENST00000586851 ARID3CA6NKF2 412 aa10.06□□□□□ -0.8
CAPNS1-202ENST00000586851 NEFMP07197 916 aa10.06□□□□□ -0.8
CAPNS1-202ENST00000586851 GOLGA2Q08379 1002 aa10.06□□□□□ -0.8
CAPNS1-202ENST00000586851 KNSTRNQ9Y448 316 aa10.06□□□□□ -0.8
CAPNS1-202ENST00000586851 ABCC1P33527 1531 aa10.06□□□□□ -0.8
CAPNS1-202ENST00000586851 PTPRTO14522 1441 aa10.06□□□□□ -0.8
CAPNS1-202ENST00000586851 KDM2BQ8NHM5 1336 aa10.06□□□□□ -0.8
CAPNS1-202ENST00000586851 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa10.06□□□□□ -0.8
CAPNS1-202ENST00000586851 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
CAPNS1-202ENST00000586851 MYO3AQ8NEV4 1616 aa10.05□□□□□ -0.8
CAPNS1-202ENST00000586851 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa10.05□□□□□ -0.8
CAPNS1-202ENST00000586851 CGNL1Q0VF96 1302 aa10.05□□□□□ -0.8
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF521Q96K83 1311 aa10.05□□□□□ -0.8
CAPNS1-202ENST00000586851 PLCH2O75038 1416 aa10.04□□□□□ -0.8
CAPNS1-202ENST00000586851 KANK1Q14678 1352 aa10.03□□□□□ -0.8
CAPNS1-202ENST00000586851 DISP3Q9P2K9 1392 aa10.03□□□□□ -0.8
CAPNS1-202ENST00000586851 PDE3AQ14432 1141 aa10.03□□□□□ -0.8
CAPNS1-202ENST00000586851 MYOM1P52179 1685 aa10.02□□□□□ -0.8
CAPNS1-202ENST00000586851 E9PSI1 815 aa10.02□□□□□ -0.81
CAPNS1-202ENST00000586851 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP10.02□□□□□ -0.81
CAPNS1-202ENST00000586851 PANK3Q9H999 370 aa10.02□□□□□ -0.81
CAPNS1-202ENST00000586851 USP32Q8NFA0 1604 aa10.02□□□□□ -0.81
CAPNS1-202ENST00000586851 VWDEQ8N2E2 1590 aa10.01□□□□□ -0.81
CAPNS1-202ENST00000586851 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa10.01□□□□□ -0.81
CAPNS1-202ENST00000586851 BECN1Q14457 450 aa10.01□□□□□ -0.81
CAPNS1-202ENST00000586851 GSE1Q14687 1217 aa10.01□□□□□ -0.81
CAPNS1-202ENST00000586851 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa10.01□□□□□ -0.81
CAPNS1-202ENST00000586851 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
CAPNS1-202ENST00000586851 CRBNQ96SW2 442 aa10.01□□□□□ -0.81
CAPNS1-202ENST00000586851 PPP2R1AP30153 589 aa10□□□□□ -0.81
CAPNS1-202ENST00000586851 DUSP27Q5VZP5 1158 aa10□□□□□ -0.81
CAPNS1-202ENST00000586851 ADGRL1O94910 1474 aa9.99□□□□□ -0.81
CAPNS1-202ENST00000586851 KIF1BO60333 1816 aa9.99□□□□□ -0.81
CAPNS1-202ENST00000586851 SLFN5Q08AF3 891 aa9.99□□□□□ -0.81
CAPNS1-202ENST00000586851 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CAPNS1-202ENST00000586851 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa9.99□□□□□ -0.81
CAPNS1-202ENST00000586851 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CAPNS1-202ENST00000586851 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa9.98□□□□□ -0.81
CAPNS1-202ENST00000586851 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
CAPNS1-202ENST00000586851 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
CAPNS1-202ENST00000586851 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
CAPNS1-202ENST00000586851 IFT172Q9UG01 1749 aa9.98□□□□□ -0.81
CAPNS1-202ENST00000586851 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
CAPNS1-202ENST00000586851 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
CAPNS1-202ENST00000586851 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
CAPNS1-202ENST00000586851 LMTK2Q8IWU2 1503 aa9.97□□□□□ -0.81
CAPNS1-202ENST00000586851 CLTCL1P53675 1640 aa9.96□□□□□ -0.81
CAPNS1-202ENST00000586851 CHD1O14646 1710 aa9.96□□□□□ -0.81
CAPNS1-202ENST00000586851 NBPF1Q3BBV0 1214 aa9.96□□□□□ -0.82
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CAPNS1-202ENST00000586851 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa9.96□□□□□ -0.82
CAPNS1-202ENST00000586851 DNAJC5BQ9UF47 199 aa9.96□□□□□ -0.82
CAPNS1-202ENST00000586851 ADAMTS8Q9UP79 889 aa9.96□□□□□ -0.82
CAPNS1-202ENST00000586851 NSD2O96028 1365 aa9.96□□□□□ -0.82
CAPNS1-202ENST00000586851 FANCAO15360 1455 aa9.96□□□□□ -0.82
CAPNS1-202ENST00000586851 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CAPNS1-202ENST00000586851 FBLN2P98095 1184 aa9.95□□□□□ -0.82
CAPNS1-202ENST00000586851 CDCA7LQ96GN5 454 aa9.95□□□□□ -0.82
CAPNS1-202ENST00000586851 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa9.95□□□□□ -0.82
CAPNS1-202ENST00000586851 NRXN1Q9ULB1 1477 aa9.95□□□□□ -0.82
CAPNS1-202ENST00000586851 ATP7AQ04656 1500 aa9.94□□□□□ -0.82
CAPNS1-202ENST00000586851 NFKBIBQ15653 356 aa9.94□□□□□ -0.82
CAPNS1-202ENST00000586851 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CAPNS1-202ENST00000586851 ABCA9Q8IUA7 1624 aa9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-202ENST00000586851 CFAP74Q9C0B2 1584 aa9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-202ENST00000586851 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC27Q2M243 656 aa9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-202ENST00000586851 RGL3Q3MIN7 710 aa9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-202ENST00000586851 C8orf34Q49A92 452 aa9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-202ENST00000586851 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-202ENST00000586851 EFCAB6Q5THR3 1501 aa9.92□□□□□ -0.82
CAPNS1-202ENST00000586851 WDR63Q8IWG1 891 aa9.92□□□□□ -0.82
CAPNS1-202ENST00000586851 ABCA6Q8N139 1617 aa9.92□□□□□ -0.82
CAPNS1-202ENST00000586851 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
CAPNS1-202ENST00000586851 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
CAPNS1-202ENST00000586851 PTMSP20962 102 aa9.91□□□□□ -0.82
CAPNS1-202ENST00000586851 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM43AQ8N2R8 423 aa9.91□□□□□ -0.82
CAPNS1-202ENST00000586851 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
CAPNS1-202ENST00000586851 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa9.9□□□□□ -0.82
CAPNS1-202ENST00000586851 CLUAP1Q96AJ1 413 aa9.9□□□□□ -0.82
CAPNS1-202ENST00000586851 CFAP53Q96M91 514 aa9.9□□□□□ -0.82
CAPNS1-202ENST00000586851 ERVK-7P63135 1459 aa9.9□□□□□ -0.83
CAPNS1-202ENST00000586851 ADGRB3O60242 1522 aa9.89□□□□□ -0.83
CAPNS1-202ENST00000586851 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP9.89□□□□□ -0.83
CAPNS1-202ENST00000586851 RSPH6AQ9H0K4 717 aa9.89□□□□□ -0.83
CAPNS1-202ENST00000586851 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CAPNS1-202ENST00000586851 MYH16Q9H6N6 1097 aa9.89□□□□□ -0.83
CAPNS1-202ENST00000586851 REREQ9P2R6 1566 aa9.88□□□□□ -0.83
CAPNS1-202ENST00000586851 IQSEC2Q5JU85 1478 aa9.88□□□□□ -0.83
CAPNS1-202ENST00000586851 PLIN1O60240 522 aa9.88□□□□□ -0.83
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