RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556749.1

TTC7B-210, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 7B, humanhuman

TSL 4

Gene TTC7B, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7B-210ENST00000556749 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
TTC7B-210ENST00000556749 SOCS7O14512 581 aa7.21□□□□□ -1.26
TTC7B-210ENST00000556749 POTEIP0CG38 1075 aa7.21□□□□□ -1.26
TTC7B-210ENST00000556749 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
TTC7B-210ENST00000556749 SHANK2Q9UPX8 1470 aa7.21□□□□□ -1.26
TTC7B-210ENST00000556749 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.26
TTC7B-210ENST00000556749 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa7.2□□□□□ -1.26
TTC7B-210ENST00000556749 VWDEQ8N2E2 1590 aa7.2□□□□□ -1.26
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TTC7B-210ENST00000556749 ARHGAP23Q9P227 1491 aa7.18□□□□□ -1.26
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TTC7B-210ENST00000556749 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
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TTC7B-210ENST00000556749 FGD6Q6ZV73 1430 aa7.15□□□□□ -1.27
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TTC7B-210ENST00000556749 FBXO3Q9UK99 471 aa7.14□□□□□ -1.27
TTC7B-210ENST00000556749 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
TTC7B-210ENST00000556749 TMEM2Q9UHN6 1383 aa7.13□□□□□ -1.27
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TTC7B-210ENST00000556749 NOS1P29475 1434 aa7.12□□□□□ -1.27
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TTC7B-210ENST00000556749 EFCAB6Q5THR3 1501 aa7.08□□□□□ -1.28
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TTC7B-210ENST00000556749 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
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TTC7B-210ENST00000556749 CHIC2Q9UKJ5 165 aa7.08□□□□□ -1.28
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TTC7B-210ENST00000556749 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
TTC7B-210ENST00000556749 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa7.07□□□□□ -1.28
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TTC7B-210ENST00000556749 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
TTC7B-210ENST00000556749 ADGRB3O60242 1522 aa7.06□□□□□ -1.28
TTC7B-210ENST00000556749 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
TTC7B-210ENST00000556749 NWD1Q149M9 1564 aa7.05□□□□□ -1.28
TTC7B-210ENST00000556749 SLC26A8Q96RN1 970 aa7.05□□□□□ -1.28
TTC7B-210ENST00000556749 ROCK1Q13464 1354 aa7.05□□□□□ -1.28
TTC7B-210ENST00000556749 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa7.05□□□□□ -1.28
TTC7B-210ENST00000556749 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
TTC7B-210ENST00000556749 PYGBP11216 843 aa7.04□□□□□ -1.28
TTC7B-210ENST00000556749 LHX8Q68G74 356 aa7.04□□□□□ -1.28
TTC7B-210ENST00000556749 FAM212AQ96EL1 285 aa7.04□□□□□ -1.28
TTC7B-210ENST00000556749 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa7.03□□□□□ -1.28
TTC7B-210ENST00000556749 TBX22Q9Y458 520 aa7.03□□□□□ -1.28
TTC7B-210ENST00000556749 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
TTC7B-210ENST00000556749 UNC13BO14795 1591 aa7.03□□□□□ -1.28
TTC7B-210ENST00000556749 RIMS2Q9UQ26 1411 aa7.02□□□□□ -1.29
TTC7B-210ENST00000556749 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa7.02□□□□□ -1.29
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