RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543447.5

ATE1-209, Transcript of arginyltransferase 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATE1, Length 4,826 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1-209ENST00000543447 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa20.27■□□□□ 0.84
ATE1-209ENST00000543447 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.26■□□□□ 0.83
ATE1-209ENST00000543447 ADGRL2O95490 1459 aa20.26■□□□□ 0.83
ATE1-209ENST00000543447 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
ATE1-209ENST00000543447 PLEKHG5O94827 1062 aa20.26■□□□□ 0.83
ATE1-209ENST00000543447 RUNDC1Q96C34 613 aa20.26■□□□□ 0.83
ATE1-209ENST00000543447 FAM135AQ9P2D6 1515 aa20.25■□□□□ 0.83
ATE1-209ENST00000543447 SHANK2Q9UPX8 1470 aa20.24■□□□□ 0.83
ATE1-209ENST00000543447 CABP2Q9NPB3 220 aa20.24■□□□□ 0.83
ATE1-209ENST00000543447 MTHFSP49914 203 aa20.24■□□□□ 0.83
ATE1-209ENST00000543447 PRAG1Q86YV5 1406 aa20.24■□□□□ 0.83
ATE1-209ENST00000543447 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.24■□□□□ 0.83
ATE1-209ENST00000543447 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
ATE1-209ENST00000543447 HDGFP51858 240 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
ATE1-209ENST00000543447 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
ATE1-209ENST00000543447 ZBTB7CA1YPR0 619 aa20.23■□□□□ 0.83
ATE1-209ENST00000543447 CEP170Q5SW79 1584 aa20.23■□□□□ 0.83
ATE1-209ENST00000543447 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa20.23■□□□□ 0.83
ATE1-209ENST00000543447 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
ATE1-209ENST00000543447 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa20.21■□□□□ 0.83
ATE1-209ENST00000543447 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
ATE1-209ENST00000543447 TCP11L2Q8N4U5 519 aa20.21■□□□□ 0.83
ATE1-209ENST00000543447 PANK1Q8TE04 598 aa20.21■□□□□ 0.83
ATE1-209ENST00000543447 GGNBP2Q9H3C7 697 aa20.2■□□□□ 0.82
ATE1-209ENST00000543447 BCAR3O75815 825 aa20.2■□□□□ 0.82
ATE1-209ENST00000543447 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa20.18■□□□□ 0.82
ATE1-209ENST00000543447 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa20.18■□□□□ 0.82
ATE1-209ENST00000543447 TESK2Q96S53 571 aa20.18■□□□□ 0.82
ATE1-209ENST00000543447 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa20.18■□□□□ 0.82
ATE1-209ENST00000543447 PLCH2O75038 1416 aa20.17■□□□□ 0.82
ATE1-209ENST00000543447 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa20.17■□□□□ 0.82
ATE1-209ENST00000543447 RAPGEF3O95398 923 aa20.17■□□□□ 0.82
ATE1-209ENST00000543447 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
ATE1-209ENST00000543447 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
ATE1-209ENST00000543447 BACH2Q9BYV9 841 aa20.16■□□□□ 0.82
ATE1-209ENST00000543447 C20orf194Q5TEA3 1177 aa20.15■□□□□ 0.82
ATE1-209ENST00000543447 PARD3Q8TEW0 1356 aa20.15■□□□□ 0.82
ATE1-209ENST00000543447 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
ATE1-209ENST00000543447 ADGRL1O94910 1474 aa20.14■□□□□ 0.81
ATE1-209ENST00000543447 DUOX2Q9NRD8 1548 aa20.13■□□□□ 0.81
ATE1-209ENST00000543447 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
ATE1-209ENST00000543447 SKAP1Q86WV1 359 aa20.13■□□□□ 0.81
ATE1-209ENST00000543447 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
ATE1-209ENST00000543447 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa20.13■□□□□ 0.81
ATE1-209ENST00000543447 NUTM2FA1L443 756 aa20.13■□□□□ 0.81
ATE1-209ENST00000543447 SLFN5Q08AF3 891 aa20.13■□□□□ 0.81
ATE1-209ENST00000543447 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
ATE1-209ENST00000543447 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
ATE1-209ENST00000543447 HSCBQ8IWL3 235 aa20.12■□□□□ 0.81
ATE1-209ENST00000543447 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
ATE1-209ENST00000543447 RIPK4P57078 832 aa20.12■□□□□ 0.81
ATE1-209ENST00000543447 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
ATE1-209ENST00000543447 FANCAO15360 1455 aa20.11■□□□□ 0.81
ATE1-209ENST00000543447 USP35Q9P2H5 1018 aa20.1■□□□□ 0.81
ATE1-209ENST00000543447 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
ATE1-209ENST00000543447 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
ATE1-209ENST00000543447 FAM69CQ0P6D2 419 aa20.09■□□□□ 0.81
ATE1-209ENST00000543447 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20.08■□□□□ 0.81
ATE1-209ENST00000543447 NSD3Q9BZ95 1437 aa20.08■□□□□ 0.8
ATE1-209ENST00000543447 APBB1O00213 710 aa20.08■□□□□ 0.8
ATE1-209ENST00000543447 CASC1Q6TDU7 716 aa20.08■□□□□ 0.8
ATE1-209ENST00000543447 DUSP27Q5VZP5 1158 aa20.07■□□□□ 0.8
ATE1-209ENST00000543447 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
ATE1-209ENST00000543447 ADGBQ8N7X0 1667 aa20.07■□□□□ 0.8
ATE1-209ENST00000543447 PRAM1Q96QH2 718 aa20.07■□□□□ 0.8
ATE1-209ENST00000543447 A2MP01023 1474 aa20.06■□□□□ 0.8
ATE1-209ENST00000543447 PDE3AQ14432 1141 aa20.06■□□□□ 0.8
ATE1-209ENST00000543447 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
ATE1-209ENST00000543447 WWC1Q8IX03 1113 aa20.05■□□□□ 0.8
ATE1-209ENST00000543447 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
ATE1-209ENST00000543447 GOLGA6L22H0YM25 854 aa20.05■□□□□ 0.8
ATE1-209ENST00000543447 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa20.05■□□□□ 0.8
ATE1-209ENST00000543447 COG3Q96JB2 828 aa20.04■□□□□ 0.8
ATE1-209ENST00000543447 MBD5Q9P267 1494 aa20.04■□□□□ 0.8
ATE1-209ENST00000543447 DDX19BQ9UMR2 479 aa20.03■□□□□ 0.8
ATE1-209ENST00000543447 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
ATE1-209ENST00000543447 CD109Q6YHK3 1445 aa20.03■□□□□ 0.8
ATE1-209ENST00000543447 HMOX1P09601 288 aa20.02■□□□□ 0.8
ATE1-209ENST00000543447 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.02■□□□□ 0.8
ATE1-209ENST00000543447 LMOD3Q0VAK6 560 aa20.02■□□□□ 0.8
ATE1-209ENST00000543447 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
ATE1-209ENST00000543447 SLC52A1Q9NWF4 448 aa20.02■□□□□ 0.79
ATE1-209ENST00000543447 ABCA8O94911 1581 aa20.01■□□□□ 0.79
ATE1-209ENST00000543447 NOS1P29475 1434 aa20.01■□□□□ 0.79
ATE1-209ENST00000543447 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.01■□□□□ 0.79
ATE1-209ENST00000543447 LMOD2Q6P5Q4 547 aa20.01■□□□□ 0.79
ATE1-209ENST00000543447 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
ATE1-209ENST00000543447 NCLP19338 710 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
ATE1-209ENST00000543447 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
ATE1-209ENST00000543447 ABCC2Q92887 1545 aa20■□□□□ 0.79
ATE1-209ENST00000543447 WDR63Q8IWG1 891 aa19.99■□□□□ 0.79
ATE1-209ENST00000543447 CABP1Q9NZU7 370 aa19.97■□□□□ 0.79
ATE1-209ENST00000543447 AAMPQ13685 434 aa19.97■□□□□ 0.79
ATE1-209ENST00000543447 ANKRD45Q5TZF3 282 aa19.97■□□□□ 0.79
ATE1-209ENST00000543447 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
ATE1-209ENST00000543447 CDK19Q9BWU1 502 aa19.96■□□□□ 0.79
ATE1-209ENST00000543447 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
ATE1-209ENST00000543447 ARHGEF5Q12774 1597 aa19.95■□□□□ 0.78
ATE1-209ENST00000543447 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
ATE1-209ENST00000543447 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms