RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264346.11

HERC6-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 6, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC6, Length 3,779 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6-201ENST00000264346 LMOD2Q6P5Q4 547 aa16.12■□□□□ 0.17
HERC6-201ENST00000264346 ITPRIPQ8IWB1 547 aa16.12■□□□□ 0.17
HERC6-201ENST00000264346 PANK1Q8TE04 598 aa16.12■□□□□ 0.17
HERC6-201ENST00000264346 C20orf194Q5TEA3 1177 aa16.11■□□□□ 0.17
HERC6-201ENST00000264346 CEP170Q5SW79 1584 aa16.11■□□□□ 0.17
HERC6-201ENST00000264346 CGNL1Q0VF96 1302 aa16.11■□□□□ 0.17
HERC6-201ENST00000264346 EVC2Q86UK5 1308 aa16.11■□□□□ 0.17
HERC6-201ENST00000264346 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
HERC6-201ENST00000264346 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
HERC6-201ENST00000264346 TERF2IPQ9NYB0 399 aa16.1■□□□□ 0.17
HERC6-201ENST00000264346 APBB1O00213 710 aa16.1■□□□□ 0.17
HERC6-201ENST00000264346 TEX14Q8IWB6 1497 aa16.1■□□□□ 0.17
HERC6-201ENST00000264346 TRHP20396 242 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
HERC6-201ENST00000264346 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa16.09■□□□□ 0.17
HERC6-201ENST00000264346 E9PSI1 815 aa16.08■□□□□ 0.16
HERC6-201ENST00000264346 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
HERC6-201ENST00000264346 NUP160Q12769 1436 aa16.08■□□□□ 0.16
HERC6-201ENST00000264346 TCP11L2Q8N4U5 519 aa16.08■□□□□ 0.16
HERC6-201ENST00000264346 MYH16Q9H6N6 1097 aa16.07■□□□□ 0.16
HERC6-201ENST00000264346 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
HERC6-201ENST00000264346 TESK2Q96S53 571 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC6-201ENST00000264346 ITSN2Q9NZM3 1697 aa16.05■□□□□ 0.16
HERC6-201ENST00000264346 BRPF3Q9ULD4 1205 aa16.05■□□□□ 0.16
HERC6-201ENST00000264346 HMOX1P09601 288 aa16.05■□□□□ 0.16
HERC6-201ENST00000264346 FAM135AQ9P2D6 1515 aa16.04■□□□□ 0.16
HERC6-201ENST00000264346 BECN1Q14457 450 aa16.04■□□□□ 0.16
HERC6-201ENST00000264346 PRAM1Q96QH2 718 aa16.04■□□□□ 0.16
HERC6-201ENST00000264346 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
HERC6-201ENST00000264346 ADGRL1O94910 1474 aa16.02■□□□□ 0.16
HERC6-201ENST00000264346 PRAG1Q86YV5 1406 aa16.02■□□□□ 0.15
HERC6-201ENST00000264346 RALGAPBQ86X10 1494 aa16.02■□□□□ 0.15
HERC6-201ENST00000264346 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
HERC6-201ENST00000264346 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HERC6-201ENST00000264346 RUNDC1Q96C34 613 aa16.01■□□□□ 0.15
HERC6-201ENST00000264346 RIPK4P57078 832 aa16■□□□□ 0.15
HERC6-201ENST00000264346 STAC3Q96MF2 364 aa16■□□□□ 0.15
HERC6-201ENST00000264346 FANCAO15360 1455 aa16■□□□□ 0.15
HERC6-201ENST00000264346 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
HERC6-201ENST00000264346 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
HERC6-201ENST00000264346 GCC2Q8IWJ2 1684 aa15.99■□□□□ 0.15
HERC6-201ENST00000264346 PLCH2O75038 1416 aa15.99■□□□□ 0.15
HERC6-201ENST00000264346 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
HERC6-201ENST00000264346 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa15.98■□□□□ 0.15
HERC6-201ENST00000264346 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
HERC6-201ENST00000264346 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
HERC6-201ENST00000264346 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa15.98■□□□□ 0.15
HERC6-201ENST00000264346 IDI1Q13907 227 aa15.97■□□□□ 0.15
HERC6-201ENST00000264346 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
HERC6-201ENST00000264346 CABP1Q9NZU7 370 aa15.97■□□□□ 0.15
HERC6-201ENST00000264346 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
HERC6-201ENST00000264346 FBLN1P23142 703 aa15.97■□□□□ 0.15
HERC6-201ENST00000264346 CD109Q6YHK3 1445 aa15.97■□□□□ 0.15
HERC6-201ENST00000264346 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
HERC6-201ENST00000264346 FAM161AQ3B820 660 aa15.96■□□□□ 0.15
HERC6-201ENST00000264346 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
HERC6-201ENST00000264346 TXNDC2Q86VQ3 553 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC6-201ENST00000264346 NSD3Q9BZ95 1437 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC6-201ENST00000264346 MS4A1P11836 297 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC6-201ENST00000264346 HDGFP51858 240 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
HERC6-201ENST00000264346 TPRNQ4KMQ1 711 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC6-201ENST00000264346 WAPLQ7Z5K2 1190 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC6-201ENST00000264346 NOS1P29475 1434 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC6-201ENST00000264346 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HERC6-201ENST00000264346 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC6-201ENST00000264346 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HERC6-201ENST00000264346 ADGRL2O95490 1459 aa15.93■□□□□ 0.14
HERC6-201ENST00000264346 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa15.93■□□□□ 0.14
HERC6-201ENST00000264346 SLFN5Q08AF3 891 aa15.93■□□□□ 0.14
HERC6-201ENST00000264346 A2MP01023 1474 aa15.93■□□□□ 0.14
HERC6-201ENST00000264346 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
HERC6-201ENST00000264346 DUSP27Q5VZP5 1158 aa15.92■□□□□ 0.14
HERC6-201ENST00000264346 WWC1Q8IX03 1113 aa15.92■□□□□ 0.14
HERC6-201ENST00000264346 MBD5Q9P267 1494 aa15.91■□□□□ 0.14
HERC6-201ENST00000264346 ABCC10Q5T3U5 1492 aa15.91■□□□□ 0.14
HERC6-201ENST00000264346 SLC4A10Q6U841 1118 aa15.91■□□□□ 0.14
HERC6-201ENST00000264346 CDK19Q9BWU1 502 aa15.91■□□□□ 0.14
HERC6-201ENST00000264346 COG3Q96JB2 828 aa15.9■□□□□ 0.14
HERC6-201ENST00000264346 BACH2Q9BYV9 841 aa15.9■□□□□ 0.14
HERC6-201ENST00000264346 NUTM2GQ5VZR2 741 aa15.9■□□□□ 0.14
HERC6-201ENST00000264346 CARD14Q9BXL6 1004 aa15.9■□□□□ 0.14
HERC6-201ENST00000264346 PARD3Q8TEW0 1356 aa15.9■□□□□ 0.14
HERC6-201ENST00000264346 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
HERC6-201ENST00000264346 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
HERC6-201ENST00000264346 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
HERC6-201ENST00000264346 FOXD4L1Q9NU39 408 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC6-201ENST00000264346 PRKAR2BP31323 418 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC6-201ENST00000264346 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
HERC6-201ENST00000264346 ASXL2Q76L83 1435 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC6-201ENST00000264346 SHANK2Q9UPX8 1470 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC6-201ENST00000264346 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
HERC6-201ENST00000264346 KDM5BQ9UGL1 1544 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC6-201ENST00000264346 NECTIN2Q92692 538 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC6-201ENST00000264346 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
HERC6-201ENST00000264346 DUOX2Q9NRD8 1548 aa15.87■□□□□ 0.13
HERC6-201ENST00000264346 AMPHP49418 695 aa15.86■□□□□ 0.13
HERC6-201ENST00000264346 A0A0G2JS52 829 aa15.86■□□□□ 0.13
HERC6-201ENST00000264346 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
HERC6-201ENST00000264346 ANKRD45Q5TZF3 282 aa15.86■□□□□ 0.13
HERC6-201ENST00000264346 SLC26A8Q96RN1 970 aa15.86■□□□□ 0.13
HERC6-201ENST00000264346 LNPKQ9C0E8 428 aa15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms