RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258098.6

RAB11FIP5-201, Transcript of RAB11 family interacting protein 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11FIP5, Length 4,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
RAB11FIP5-201ENST00000258098 EVC2Q86UK5 1308 aa24.84■■□□□ 1.57
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.84■■□□□ 1.57
RAB11FIP5-201ENST00000258098 BECN1Q14457 450 aa24.83■■□□□ 1.57
RAB11FIP5-201ENST00000258098 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.82■■□□□ 1.56
RAB11FIP5-201ENST00000258098 E9PSI1 815 aa24.82■■□□□ 1.56
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.74■■□□□ 1.55
RAB11FIP5-201ENST00000258098 HMOX1P09601 288 aa24.73■■□□□ 1.55
RAB11FIP5-201ENST00000258098 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP5-201ENST00000258098 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP5-201ENST00000258098 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CEP170Q5SW79 1584 aa24.7■■□□□ 1.54
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PRAM1Q96QH2 718 aa24.7■■□□□ 1.54
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RUNDC1Q96C34 613 aa24.7■■□□□ 1.54
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TESK2Q96S53 571 aa24.7■■□□□ 1.54
RAB11FIP5-201ENST00000258098 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RIPK4P57078 832 aa24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP5-201ENST00000258098 NUP160Q12769 1436 aa24.67■■□□□ 1.54
RAB11FIP5-201ENST00000258098 STAC3Q96MF2 364 aa24.67■■□□□ 1.54
RAB11FIP5-201ENST00000258098 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP5-201ENST00000258098 MS4A1P11836 297 aa24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP5-201ENST00000258098 FAM161AQ3B820 660 aa24.65■■□□□ 1.54
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TPRNQ4KMQ1 711 aa24.65■■□□□ 1.54
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.65■■□□□ 1.54
RAB11FIP5-201ENST00000258098 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.64■■□□□ 1.54
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.64■■□□□ 1.53
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ADGRL1O94910 1474 aa24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP5-201ENST00000258098 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP5-201ENST00000258098 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP5-201ENST00000258098 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP5-201ENST00000258098 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CABP1Q9NZU7 370 aa24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP5-201ENST00000258098 FANCAO15360 1455 aa24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PLCH2O75038 1416 aa24.58■■□□□ 1.52
RAB11FIP5-201ENST00000258098 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
RAB11FIP5-201ENST00000258098 NSD3Q9BZ95 1437 aa24.57■■□□□ 1.52
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.56■■□□□ 1.52
RAB11FIP5-201ENST00000258098 IDI1Q13907 227 aa24.56■■□□□ 1.52
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SLC4A10Q6U841 1118 aa24.56■■□□□ 1.52
RAB11FIP5-201ENST00000258098 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.56■■□□□ 1.52
RAB11FIP5-201ENST00000258098 FBLN1P23142 703 aa24.56■■□□□ 1.52
RAB11FIP5-201ENST00000258098 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
RAB11FIP5-201ENST00000258098 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SLFN5Q08AF3 891 aa24.55■■□□□ 1.52
RAB11FIP5-201ENST00000258098 FOXD4L1Q9NU39 408 aa24.55■■□□□ 1.52
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CD109Q6YHK3 1445 aa24.55■■□□□ 1.52
RAB11FIP5-201ENST00000258098 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
RAB11FIP5-201ENST00000258098 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.54■■□□□ 1.52
RAB11FIP5-201ENST00000258098 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
RAB11FIP5-201ENST00000258098 COG3Q96JB2 828 aa24.54■■□□□ 1.52
RAB11FIP5-201ENST00000258098 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.53■■□□□ 1.52
RAB11FIP5-201ENST00000258098 WWC1Q8IX03 1113 aa24.53■■□□□ 1.52
RAB11FIP5-201ENST00000258098 BACH2Q9BYV9 841 aa24.53■■□□□ 1.52
RAB11FIP5-201ENST00000258098 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
RAB11FIP5-201ENST00000258098 NCLP19338 710 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
RAB11FIP5-201ENST00000258098 NOS1P29475 1434 aa24.53■■□□□ 1.52
RAB11FIP5-201ENST00000258098 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.52■■□□□ 1.52
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CDK19Q9BWU1 502 aa24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP5-201ENST00000258098 A0A0G2JS52 829 aa24.5■■□□□ 1.51
RAB11FIP5-201ENST00000258098 NUTM2GQ5VZR2 741 aa24.5■■□□□ 1.51
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PRKAR2BP31323 418 aa24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP5-201ENST00000258098 NECTIN2Q92692 538 aa24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ADGRL2O95490 1459 aa24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ANKRD45Q5TZF3 282 aa24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP5-201ENST00000258098 A2MP01023 1474 aa24.48■■□□□ 1.51
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.48■■□□□ 1.51
RAB11FIP5-201ENST00000258098 AMPHP49418 695 aa24.48■■□□□ 1.51
RAB11FIP5-201ENST00000258098 HSCBQ8IWL3 235 aa24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP5-201ENST00000258098 LNPKQ9C0E8 428 aa24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP5-201ENST00000258098 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.45■■□□□ 1.51
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.51
RAB11FIP5-201ENST00000258098 EID1Q9Y6B2 187 aa24.44■■□□□ 1.5
RAB11FIP5-201ENST00000258098 C1orf115Q9H7X2 142 aa24.43■■□□□ 1.5
RAB11FIP5-201ENST00000258098 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.43■■□□□ 1.5
RAB11FIP5-201ENST00000258098 MBD5Q9P267 1494 aa24.43■■□□□ 1.5
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.43■■□□□ 1.5
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.42■■□□□ 1.5
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
RAB11FIP5-201ENST00000258098 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.42■■□□□ 1.5
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ASXL2Q76L83 1435 aa24.41■■□□□ 1.5
RAB11FIP5-201ENST00000258098 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.41■■□□□ 1.5
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms