RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000064571.2

CBLN4-201, Transcript of cerebellin 4 precursor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CBLN4, Length 3,024 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN4-201ENST00000064571 TMC1Q8TDI8 760 aa20.67■□□□□ 0.9
CBLN4-201ENST00000064571 TRAK1Q9UPV9 953 aa20.67■□□□□ 0.9
CBLN4-201ENST00000064571 PTPRTO14522 1441 aa20.67■□□□□ 0.9
CBLN4-201ENST00000064571 TMF1P82094 1093 aa20.67■□□□□ 0.9
CBLN4-201ENST00000064571 NPATQ14207 1427 aa20.67■□□□□ 0.9
CBLN4-201ENST00000064571 CLTCL1P53675 1640 aa20.67■□□□□ 0.9
CBLN4-201ENST00000064571 MLH3Q9UHC1 1453 aa20.66■□□□□ 0.9
CBLN4-201ENST00000064571 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP20.66■□□□□ 0.9
CBLN4-201ENST00000064571 MROH1Q8NDA8 1641 aa20.65■□□□□ 0.9
CBLN4-201ENST00000064571 IDI1Q13907 227 aa20.64■□□□□ 0.89
CBLN4-201ENST00000064571 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa20.64■□□□□ 0.89
CBLN4-201ENST00000064571 NUDCQ9Y266 331 aa20.64■□□□□ 0.89
CBLN4-201ENST00000064571 NEO1Q92859 1461 aa20.63■□□□□ 0.89
CBLN4-201ENST00000064571 TRPM2O94759 1503 aa20.63■□□□□ 0.89
CBLN4-201ENST00000064571 HECW2Q9P2P5 1572 aa20.62■□□□□ 0.89
CBLN4-201ENST00000064571 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa20.61■□□□□ 0.89
CBLN4-201ENST00000064571 ABCA6Q8N139 1617 aa20.61■□□□□ 0.89
CBLN4-201ENST00000064571 EXOC6Q8TAG9 804 aa20.61■□□□□ 0.89
CBLN4-201ENST00000064571 NOS1P29475 1434 aa20.61■□□□□ 0.89
CBLN4-201ENST00000064571 STK26Q9P289 416 aa20.61■□□□□ 0.89
CBLN4-201ENST00000064571 GPRASP1Q5JY77 1395 aa20.6■□□□□ 0.89
CBLN4-201ENST00000064571 SLC4A3P48751 1232 aa20.6■□□□□ 0.89
CBLN4-201ENST00000064571 TET3O43151 1660 aa20.6■□□□□ 0.89
CBLN4-201ENST00000064571 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
CBLN4-201ENST00000064571 STAG3Q9UJ98 1225 aa20.59■□□□□ 0.89
CBLN4-201ENST00000064571 BRPF3Q9ULD4 1205 aa20.59■□□□□ 0.89
CBLN4-201ENST00000064571 CEP152O94986 1710 aa20.59■□□□□ 0.89
CBLN4-201ENST00000064571 DEPDC5O75140 1603 aa20.59■□□□□ 0.89
CBLN4-201ENST00000064571 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
CBLN4-201ENST00000064571 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa20.58■□□□□ 0.89
CBLN4-201ENST00000064571 VWDEQ8N2E2 1590 aa20.57■□□□□ 0.88
CBLN4-201ENST00000064571 EFCAB6Q5THR3 1501 aa20.56■□□□□ 0.88
CBLN4-201ENST00000064571 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
CBLN4-201ENST00000064571 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CBLN4-201ENST00000064571 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CBLN4-201ENST00000064571 CFAP74Q9C0B2 1584 aa20.53■□□□□ 0.88
CBLN4-201ENST00000064571 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
CBLN4-201ENST00000064571 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CBLN4-201ENST00000064571 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa20.52■□□□□ 0.88
CBLN4-201ENST00000064571 PLIN1O60240 522 aa20.52■□□□□ 0.88
CBLN4-201ENST00000064571 PDE4AP27815 886 aa20.51■□□□□ 0.87
CBLN4-201ENST00000064571 ABCC3O15438 1527 aa20.51■□□□□ 0.87
CBLN4-201ENST00000064571 KNSTRNQ9Y448 316 aa20.51■□□□□ 0.87
CBLN4-201ENST00000064571 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CBLN4-201ENST00000064571 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CBLN4-201ENST00000064571 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CBLN4-201ENST00000064571 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa20.5■□□□□ 0.87
CBLN4-201ENST00000064571 DIP2BQ9P265 1576 aa20.5■□□□□ 0.87
CBLN4-201ENST00000064571 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CBLN4-201ENST00000064571 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CBLN4-201ENST00000064571 MADDQ8WXG6 1647 aa20.48■□□□□ 0.87
CBLN4-201ENST00000064571 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CBLN4-201ENST00000064571 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CBLN4-201ENST00000064571 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CBLN4-201ENST00000064571 RALBP1Q15311 655 aa20.46■□□□□ 0.87
CBLN4-201ENST00000064571 RICTORQ6R327 1708 aa20.45■□□□□ 0.86
CBLN4-201ENST00000064571 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CBLN4-201ENST00000064571 VGFO15240 615 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CBLN4-201ENST00000064571 STAC3Q96MF2 364 aa20.44■□□□□ 0.86
CBLN4-201ENST00000064571 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa20.44■□□□□ 0.86
CBLN4-201ENST00000064571 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CBLN4-201ENST00000064571 MROH2AA6NES4 1674 aa20.43■□□□□ 0.86
CBLN4-201ENST00000064571 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
CBLN4-201ENST00000064571 RRP1P56182 461 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
CBLN4-201ENST00000064571 NLRP13Q86W25 1043 aa20.42■□□□□ 0.86
CBLN4-201ENST00000064571 CDCA7LQ96GN5 454 aa20.42■□□□□ 0.86
CBLN4-201ENST00000064571 LMTK2Q8IWU2 1503 aa20.41■□□□□ 0.86
CBLN4-201ENST00000064571 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
CBLN4-201ENST00000064571 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
CBLN4-201ENST00000064571 CDCA8Q53HL2 280 aa20.4■□□□□ 0.86
CBLN4-201ENST00000064571 SLC52A1Q9NWF4 448 aa20.4■□□□□ 0.86
CBLN4-201ENST00000064571 RNF123Q5XPI4 1314 aa20.4■□□□□ 0.86
CBLN4-201ENST00000064571 GLI2P10070 1586 aa20.39■□□□□ 0.86
CBLN4-201ENST00000064571 CABP2Q9NPB3 220 aa20.39■□□□□ 0.85
CBLN4-201ENST00000064571 KIF1BO60333 1816 aa20.39■□□□□ 0.85
CBLN4-201ENST00000064571 CARD14Q9BXL6 1004 aa20.38■□□□□ 0.85
CBLN4-201ENST00000064571 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa20.38■□□□□ 0.85
CBLN4-201ENST00000064571 BACH2Q9BYV9 841 aa20.38■□□□□ 0.85
CBLN4-201ENST00000064571 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.38■□□□□ 0.85
CBLN4-201ENST00000064571 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CBLN4-201ENST00000064571 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CBLN4-201ENST00000064571 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa20.35■□□□□ 0.85
CBLN4-201ENST00000064571 PARD3Q8TEW0 1356 aa20.35■□□□□ 0.85
CBLN4-201ENST00000064571 ADGRB3O60242 1522 aa20.35■□□□□ 0.85
CBLN4-201ENST00000064571 SYNMO15061 1565 aa20.35■□□□□ 0.85
CBLN4-201ENST00000064571 POGKQ9P215 609 aa20.34■□□□□ 0.85
CBLN4-201ENST00000064571 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CBLN4-201ENST00000064571 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa20.34■□□□□ 0.85
CBLN4-201ENST00000064571 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CBLN4-201ENST00000064571 PPP2R1AP30153 589 aa20.33■□□□□ 0.85
CBLN4-201ENST00000064571 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CBLN4-201ENST00000064571 PIK3C2GO75747 1445 aa20.33■□□□□ 0.85
CBLN4-201ENST00000064571 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
CBLN4-201ENST00000064571 PRAM1Q96QH2 718 aa20.32■□□□□ 0.84
CBLN4-201ENST00000064571 MYOM2P54296 1465 aa20.32■□□□□ 0.84
CBLN4-201ENST00000064571 ADAMTS8Q9UP79 889 aa20.32■□□□□ 0.84
CBLN4-201ENST00000064571 NFKBIBQ15653 356 aa20.31■□□□□ 0.84
CBLN4-201ENST00000064571 WAPLQ7Z5K2 1190 aa20.31■□□□□ 0.84
CBLN4-201ENST00000064571 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.3■□□□□ 0.84
CBLN4-201ENST00000064571 CRBNQ96SW2 442 aa20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms