RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639493.1

GLDC-215, Transcript of glycine decarboxylase, human

TSL 3

Gene GLDC, Length 553 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GLDC-215	ENST00000639493	DLL1	O00548	723 aa		11.32	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	PIR	O00625	290 aa		11.32	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	TGM5	O43548	720 aa		11.32	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	EXTL3	O43909	919 aa		11.32	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	C1R	P00736	705 aa		11.32	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	POSTN	Q15063	836 aa		11.32	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	PSMD5	Q16401	504 aa		11.32	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		11.32	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		11.32	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		11.32	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	BORCS6	Q96GS4	357 aa		11.32	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		11.32	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		11.32	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		11.32	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	11.32	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		11.32	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		11.32	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		11.32	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	SYN3	O14994	580 aa		11.31	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	ADH1A	P07327	375 aa		11.31	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	KLRC2	P26717	231 aa		11.31	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	CA8	P35219	290 aa		11.31	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		11.31	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	PNOC	Q13519	176 aa		11.31	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	KCNB1	Q14721	858 aa		11.31	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		11.31	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		11.31	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		11.31	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		11.31	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		11.31	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		11.31	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		11.31	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	GPD1L	Q8N335	351 aa		11.31	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		11.31	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		11.31	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	APOL5	Q9BWW9	433 aa		11.31	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		11.31	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		11.31	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	DMAC2	Q9NW81	257 aa		11.31	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	SIX4	Q9UIU6	781 aa		11.31	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		11.31	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	PTPRD	P23468	1912 aa		11.31	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		11.3	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	CLIC2	O15247	247 aa		11.3	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	RFPL2	O75678	378 aa		11.3	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	IL18RAP	O95256	599 aa		11.3	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	VNN2	O95498	520 aa		11.3	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	GLUD1	P00367	558 aa		11.3	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	WEE2	P0C1S8	567 aa		11.3	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	SPATA31D3	P0C874	917 aa		11.3	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	LILRA4	P59901	499 aa		11.3	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	CREM	Q03060	361 aa		11.3	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	PSMD2	Q13200	908 aa		11.3	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	RAB33A	Q14088	237 aa		11.3	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		11.3	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		11.3	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		11.3	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	CEP57	Q86XR8	500 aa		11.3	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		11.3	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		11.3	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		11.3	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		11.3	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	FAM212A	Q96EL1	285 aa		11.3	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		11.3	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	POMK	Q9H5K3	350 aa		11.3	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		11.3	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		11.3	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	EXOC1	Q9NV70	894 aa		11.3	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		11.3	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		11.3	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		11.3	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		11.3	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	TECTA	O75443	2155 aa		11.29	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	WDR27	A2RRH5	827 aa		11.29	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	TRAPPC3	O43617	180 aa		11.29	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	ABLIM3	O94929	683 aa		11.29	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	OAZ2	O95190	189 aa		11.29	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		11.29	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	ROR1	Q01973	937 aa		11.29	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	ITIH3	Q06033	890 aa		11.29	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
GLDC-215	ENST00000639493	PDXDC1	Q6P996	788 aa		11.29	□□□□□ -0.6

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