RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636621.1

LINC00598-211, long intergenic non-protein coding RNA 598, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LINC00598, Length 3,241 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00598-211ENST00000636621 NPTX2P47972 431 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 WDR4P57081 412 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 UBXN2AP68543 259 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 PPARDQ03181 441 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 LRRC14Q15048 493 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 UGCGQ16739 394 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 LRRC38Q5VT99 294 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 CCDC25Q86WR0 208 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 MCF2L2Q86YR7 1114 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 RHOT1Q8IXI2 618 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 IL31RAQ8NI17 732 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 NSMCE1Q8WV22 266 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 DYDC1Q8WWB3 177 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 KLHL29Q96CT2 875 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 TLE6Q9H808 572 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 ADAM22Q9P0K1 906 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 KLHL14Q9P2G3 628 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 SPDYE2BA6NHP3 402 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 SLC16A4O15374 487 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 STBD1O95210 358 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 SPDYE6P0CI01 402 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 FOXN2P32314 431 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 PSEN1P49768 467 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 MCL1Q07820 350 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 E2F5Q15329 346 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 PDK4Q16654 411 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 CCDC174Q6PII3 467 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 ZNF398Q8TD17 642 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 ATG4AQ8WYN0 398 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 FAXDC2Q96IV6 333 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 CCDC77Q9BR77 488 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 TRIM7Q9C029 511 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 TXLNGQ9NUQ3 528 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 LCTP09848 1927 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 G3V3G9 751 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 TYROBPO43914 113 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 RALAP11233 206 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 GNAZP19086 355 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 STX2P32856 288 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 PEX3P56589 373 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 IL9RQ01113 521 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 KRT76Q01546 638 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 MAMLD1Q13495 774 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 MTMR1Q13613 665 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 ZACNQ401N2 412 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 DCAF8Q5TAQ9 597 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 XRRA1Q6P2D8 792 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 OTUD6AQ7L8S5 288 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 GPD1LQ8N335 351 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 AKT1S1Q96B36 256 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 CFAP57Q96MR6 1250 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 ZNF570Q96NI8 536 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 KIAA1586Q9HCI6 787 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 PNMA3Q9UL41 463 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 BCS1LQ9Y276 419 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 WDR64B1ANS9 1081 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 LIASO43766 372 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 PIGRP01833 764 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 ADCY8P40145 1251 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 NOMO3P69849 1222 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 MORF4L2Q15014 288 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 NSMFQ6X4W1 530 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 ANO5Q75V66 913 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 MTMR14Q8NCE2 650 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 GMLQ99445 158 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 DHRS4Q9BTZ2 278 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 OSBPL8Q9BZF1 889 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 SLC24A2Q9UI40 661 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 L3MBTL1Q9Y468 752 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 SCINQ9Y6U3 715 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 CCNE2O96020 404 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 MAGEA4P43358 317 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 ZNF132P52740 706 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 MYO1EQ12965 1108 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 PSMD6Q15008 389 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 PGM5Q15124 567 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 OASLQ15646 514 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 IZUMO3Q5VZ72 239 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.5 ms