RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616206.4

PDE4DIP-241, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PDE4DIP, Length 874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIP-241ENST00000616206 MB21D1Q8N884 522 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 KIAA1958Q8N8K9 716 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 HPS3Q969F9 1004 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 CEP95Q96GE4 821 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 CCDC138Q96M89 665 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 BOCQ9BWV1 1114 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 HELLSQ9NRZ9 838 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 FBXO28Q9NVF7 368 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 SPO11Q9Y5K1 396 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 NR2E3Q9Y5X4 410 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 STRNO43815 780 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 TIAF1O95411 115 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 TTLL1O95922 423 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 NDUFB10O96000 172 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 FCER1AP12319 257 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 ADORA2AP29274 412 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 GRK3P35626 688 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 RENBPP51606 427 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 PHC1P78364 1004 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 SLC9A5Q14940 896 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 KIAA0753Q2KHM9 967 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 LRIT3Q3SXY7 679 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 ATAT1Q5SQI0 421 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 VPS53Q5VIR6 699 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 LILRA6Q6PI73 481 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 OSTM1Q86WC4 334 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 CAMKK1Q8N5S9 505 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 PPP1R35Q8TAP8 253 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 TBCBQ99426 244 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 MAP3K14Q99558 947 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 SLF1Q9BQI6 1058 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 SELENOOQ9BVL4 669 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 APOL5Q9BWW9 433 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 MROH8Q9H579 483 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 INCENPQ9NQS7 918 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 MTMR4Q9NYA4 1195 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 NYAP2Q9P242 653 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 KCNH3Q9ULD8 1083 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 STX8Q9UNK0 236 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 SALL3Q9BXA9 1300 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 A0A0D9SFI3 127 aa8.23□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 SLC12A8A0AV02 714 aa8.23□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 VWA5AO00534 786 aa8.23□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 KCNK3O14649 394 aa8.23□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 GFRA3O60609 400 aa8.23□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZBED4O75132 1171 aa8.23□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 NID1P14543 1247 aa8.23□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 HAND2P61296 217 aa8.23□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 KCTD2Q14681 263 aa8.23□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 TMEM132BQ14DG7 1078 aa8.23□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 INF2Q27J81 1249 aa8.23□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 SLFN13Q68D06 897 aa8.23□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 OVCH2Q7RTZ1 564 aa8.23□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZNF610Q8N9Z0 462 aa8.23□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 SHCBP1Q8NEM2 672 aa8.23□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 NEDD1Q8NHV4 660 aa8.23□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 USP6NLQ92738 828 aa8.23□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 MMP19Q99542 508 aa8.23□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 PCIF1Q9H4Z3 704 aa8.23□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 FLRT1Q9NZU1 646 aa8.23□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 SCINQ9Y6U3 715 aa8.23□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 ROBO3Q96MS0 1386 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 MGAMO43451 1857 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 KDM1AO60341 852 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 NMT2O60551 498 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 SLC25A27O95847 323 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 CBX7O95931 251 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 PGK2P07205 417 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 POU2F2P09086 479 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 COL6A1P12109 1028 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 BMP3P12645 472 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 PAMP19021 973 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 C5AR1P21730 350 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 MCCP23508 829 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 SLC1A4P43007 532 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 JAM2P57087 298 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 IRF9Q00978 393 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
PDE4DIP-241ENST00000616206 GRB14Q14449 540 aa8.22□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms