RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592759.5

POP4-213, Transcript of POP4 homolog, ribonuclease P/MRP subunit, human

TSL 4

Gene POP4, Length 550 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POP4-213	ENST00000592759	LILRB3	O75022	631 aa		13.54	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	UBE3A	Q05086	875 aa		13.54	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	PPP3CA	Q08209	521 aa		13.54	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	SURF1	Q15526	300 aa		13.54	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		13.54	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		13.54	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	WDR49	Q8IV35	697 aa		13.54	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	BEST2	Q8NFU1	509 aa		13.54	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	TMEM169	Q96HH4	297 aa		13.54	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	B3GALT6	Q96L58	329 aa		13.54	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	CEP63	Q96MT8	703 aa		13.54	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		13.54	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		13.54	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	CHST7	Q9NS84	486 aa		13.54	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		13.54	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	REV3L	O60673	3130 aa		13.54	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	BICDL2	A1A5D9	508 aa		13.53	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	CARNS1	A5YM72	827 aa		13.53	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	TADA2A	O75478	443 aa		13.53	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	B3GAT3	O94766	335 aa		13.53	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	VNN1	O95497	513 aa		13.53	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	SOD2	P04179	222 aa		13.53	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	TRIM49	P0CI25	452 aa		13.53	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	TRIM49C	P0CI26	452 aa		13.53	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	VAMP7	P51809	220 aa		13.53	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	LILRA4	P59901	499 aa		13.53	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	TYRO3	Q06418	890 aa		13.53	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	ENPEP	Q07075	957 aa		13.53	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	BFSP1	Q12934	665 aa		13.53	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		13.53	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		13.53	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		13.53	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		13.53	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	VPS52	Q8N1B4	723 aa		13.53	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		13.53	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	SPOCK2	Q92563	424 aa		13.53	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
POP4-213	ENST00000592759	HIDE1	A8MVS5	230 aa		13.52	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759		M0QZQ0	153 aa		13.52	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	LRRN2	O75325	713 aa		13.52	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	CSPG5	O95196	566 aa		13.52	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	ITGB3	P05106	788 aa		13.52	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	CTSA	P10619	480 aa		13.52	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	TNNI1	P19237	187 aa		13.52	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	FGFR3	P22607	806 aa		13.52	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	KRT17	Q04695	432 aa		13.52	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	RTP2	Q5QGT7	225 aa		13.52	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		13.52	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		13.52	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		13.52	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	SLC35C1	Q96A29	364 aa		13.52	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	SUSD3	Q96L08	255 aa		13.52	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		13.52	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	TLR9	Q9NR96	1032 aa		13.52	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	ANO10	Q9NW15	660 aa		13.52	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		13.52	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		13.52	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		13.52	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	SYCE3	A1L190	88 aa		13.51	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		13.51	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	IKBKB	O14920	756 aa		13.51	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		13.51	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	DSG1	Q02413	1049 aa		13.51	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	NCAPH	Q15003	741 aa		13.51	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	PTPN14	Q15678	1187 aa		13.51	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	STX1A	Q16623	288 aa		13.51	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	ZACN	Q401N2	412 aa		13.51	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		13.51	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		13.51	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	SV2A	Q7L0J3	742 aa		13.51	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		13.51	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		13.51	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		13.51	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	FNBP1	Q96RU3	617 aa		13.51	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	TCF25	Q9BQ70	676 aa		13.51	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		13.51	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		13.51	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	IRAK3	Q9Y616	596 aa		13.51	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		13.51	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	13.5	□□□□□ -0.25
POP4-213	ENST00000592759	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25

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