RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588667.5

ATG4D-208, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATG4D, Length 1,619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-208ENST00000588667 TMC7Q7Z402 723 aa21.79■■□□□ 1.08
ATG4D-208ENST00000588667 EFCAB13Q8IY85 973 aa21.79■■□□□ 1.08
ATG4D-208ENST00000588667 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa21.79■■□□□ 1.08
ATG4D-208ENST00000588667 HASPINQ8TF76 798 aa21.79■■□□□ 1.08
ATG4D-208ENST00000588667 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa21.79■■□□□ 1.08
ATG4D-208ENST00000588667 VWA8A3KMH1 1905 aa21.79■■□□□ 1.08
ATG4D-208ENST00000588667 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
ATG4D-208ENST00000588667 PPP2R3CQ969Q6 453 aa21.78■■□□□ 1.08
ATG4D-208ENST00000588667 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa21.78■■□□□ 1.08
ATG4D-208ENST00000588667 PDE11AQ9HCR9 933 aa21.78■■□□□ 1.08
ATG4D-208ENST00000588667 SERPINC1P01008 464 aa21.77■■□□□ 1.08
ATG4D-208ENST00000588667 CTSAP10619 480 aa21.77■■□□□ 1.08
ATG4D-208ENST00000588667 ATP1A3P13637 1013 aa21.77■■□□□ 1.08
ATG4D-208ENST00000588667 FANCCQ00597 558 aa21.77■■□□□ 1.08
ATG4D-208ENST00000588667 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
ATG4D-208ENST00000588667 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
ATG4D-208ENST00000588667 EDRF1Q3B7T1 1238 aa21.77■■□□□ 1.08
ATG4D-208ENST00000588667 PLPP4Q5VZY2 271 aa21.77■■□□□ 1.08
ATG4D-208ENST00000588667 CENPPQ6IPU0 288 aa21.77■■□□□ 1.08
ATG4D-208ENST00000588667 RDH13Q8NBN7 331 aa21.77■■□□□ 1.08
ATG4D-208ENST00000588667 C3orf58Q8NDZ4 430 aa21.77■■□□□ 1.08
ATG4D-208ENST00000588667 GPR62Q9BZJ7 368 aa21.77■■□□□ 1.08
ATG4D-208ENST00000588667 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
ATG4D-208ENST00000588667 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa21.77■■□□□ 1.08
ATG4D-208ENST00000588667 SCN1AP35498 2009 aa21.77■■□□□ 1.08
ATG4D-208ENST00000588667 CBFA2T2O43439 604 aa21.77■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 NR2F2P24468 414 aa21.77■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 RPL13P26373 211 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 GUCY2FP51841 1108 aa21.77■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 CYP24A1Q07973 514 aa21.77■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 TCEAL5Q5H9L2 206 aa21.77■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 CDKAL1Q5VV42 579 aa21.77■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 TTI2Q6NXR4 508 aa21.77■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 FOXR2Q6PJQ5 311 aa21.77■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 IRAK3Q9Y616 596 aa21.77■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 URODP06132 367 aa21.76■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 CDC25BP30305 580 aa21.76■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 PSMD6Q15008 389 aa21.76■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 CD300LGQ6UXG3 332 aa21.76■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 MFSD14AQ96MC6 490 aa21.76■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 TSG101Q99816 390 aa21.76■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 IFNKQ9P0W0 207 aa21.76■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa21.76■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 TRIM49BA6NDI0 452 aa21.75■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 TRAPPC3O43617 180 aa21.75■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 TPM3P06753 285 aa21.75■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 GLUD2P49448 558 aa21.75■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 PMS1P54277 932 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 LRRC63Q05C16 580 aa21.75■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 USP41Q3LFD5 358 aa21.75■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 WDR49Q8IV35 697 aa21.75■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 TMEM130Q8N3G9 435 aa21.75■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 PPM1EQ8WY54 764 aa21.75■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 THAP9Q9H5L6 903 aa21.75■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 CHST7Q9NS84 486 aa21.75■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 DPP3Q9NY33 737 aa21.75■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa21.75■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 NUB1Q9Y5A7 615 aa21.75■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 C2orf71A6NGG8 1288 aa21.74■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 CASP4P49662 377 aa21.74■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 UBASH3AP57075 661 aa21.74■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 PTPN14Q15678 1187 aa21.74■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa21.74■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 C9orf57Q5W0N0 161 aa21.74■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 CEP135Q66GS9 1140 aa21.74■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 ANKRD40Q6AI12 368 aa21.74■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 KIAA1841Q6NSI8 718 aa21.74■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 TAS1R1Q7RTX1 841 aa21.74■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa21.74■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa21.74■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa21.74■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 FNBP1Q96RU3 617 aa21.74■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 ANO9A1A5B4 782 aa21.73■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 HIDE1A8MVS5 230 aa21.73■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 MAPK13O15264 365 aa21.73■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 CXCL14O95715 111 aa21.73■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 PTMAP06454 111 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 TMEM191BP0C7N4 346 aa21.73■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 CA8P35219 290 aa21.73■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 DSG1Q02413 1049 aa21.73■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 ADAM9Q13443 819 aa21.73■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 FAM171A1Q5VUB5 890 aa21.73■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 GPR65Q8IYL9 337 aa21.73■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 AUTS2Q8WXX7 1259 aa21.73■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 CCDC127Q96BQ5 260 aa21.73■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa21.73■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 CGRRF1Q99675 332 aa21.73■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 MTMR12Q9C0I1 747 aa21.73■■□□□ 1.07
ATG4D-208ENST00000588667 INTS13Q9NVM9 706 aa21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms