RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	ATF2	P15336	505 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	ACOT2	P49753	483 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	NTHL1	P78549	312 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	ROR1	Q01973	937 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	SPATA1	Q5VX52	437 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	TPGS2	Q68CL5	300 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	JADE1	Q6IE81	842 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF280D	Q6N043	979 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	PDILT	Q8N807	584 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	BEST2	Q8NFU1	509 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	HVCN1	Q96D96	273 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	ACCS	Q96QU6	501 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	ASB7	Q9H672	318 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	PANK4	Q9NVE7	773 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		10.21	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A087X0B3	334 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	WDR27	A2RRH5	827 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	TISP43	B9A030	160 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479		M0QZQ0	153 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	TECTA	O75443	2155 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	PPP1R37	O75864	691 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	OAZ2	O95190	189 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	GCNT3	O95395	438 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	YEATS4	O95619	227 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	PTPN2	P17706	415 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	PAX3	P23760	479 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	CLCN5	P51795	746 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	NUBP1	P53384	320 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	NHLH1	Q02575	133 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	KCNA1	Q09470	495 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	USP37	Q86T82	979 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	FGF13	Q92913	245 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	STRA6	Q9BX79	667 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	WNT16	Q9UBV4	365 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	CDH7	Q9ULB5	785 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	MAFF	Q9ULX9	164 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	DERA	Q9Y315	318 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		10.2	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	ANHX	E9PGG2	379 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	STK25	O00506	426 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	CUTA	O60888	179 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	SEC24A	O95486	1093 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	CFH	P08603	1231 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	SRF	P11831	508 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	CPB1	P15086	417 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	ADSS	P30520	456 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	GUCY2F	P51841	1108 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	PTPN5	P54829	565 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	LILRA4	P59901	499 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	AMPD3	Q01432	767 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	ADCY1	Q08828	1119 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	ALCAM	Q13740	583 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	ELMOD1	Q8N336	334 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	PRSS33	Q8NF86	280 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	FLCN	Q8NFG4	579 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	ITFG1	Q8TB96	612 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	CUEDC2	Q9H467	287 aa		10.19	□□□□□ -0.78

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