RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560965.1

CHP1-208, Transcript of calcineurin like EF-hand protein 1, human

TSL 2

Gene CHP1, Length 467 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHP1-208	ENST00000560965	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	POM121C	A8CG34	1229 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	BIN1	O00499	593 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	OGT	O15294	1046 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	PMM2	O15305	246 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	TGFB1I1	O43294	461 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	EXTL3	O43909	919 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	STX10	O60499	249 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	EOMES	O95936	686 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	NR3C1	P04150	777 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	TPM3	P06753	285 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	TPM2	P07951	284 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	ACTN1	P12814	892 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	RAG1	P15918	1043 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	NR2F2	P24468	414 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	CASP5	P51878	434 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	ADAM9	Q13443	819 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	LPIN1	Q14693	890 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	TTI2	Q6NXR4	508 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	FAM228A	Q86W67	206 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	KSR1	Q8IVT5	923 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	GPD1L	Q8N335	351 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	PGBD4	Q96DM1	585 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	DMAC2	Q9NW81	257 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	PADI3	Q9ULW8	664 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	GINS2	Q9Y248	185 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	GDA	Q9Y2T3	454 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	SCN5A	Q14524	2016 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF233	A6NK53	670 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	ABLIM1	O14639	778 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	INPPL1	O15357	1258 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	P4HA2	O15460	535 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	IL18RAP	O95256	599 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	ADRB2	P07550	413 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	CLTA	P09496	248 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	CTSH	P09668	335 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	PAX3	P23760	479 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	MSX1	P28360	303 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	ADSS	P30520	456 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	GTF2H1	P32780	548 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	HOXD13	P35453	343 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	SCTR	P47872	440 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	CLDN10	P78369	228 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	IKBKE	Q14164	716 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	WNT8B	Q93098	351 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	TCHP	Q9BT92	498 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	ALG2	Q9H553	416 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	ASB7	Q9H672	318 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	RGS18	Q9NS28	235 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CHP1-208	ENST00000560965	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41

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