RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533259.1

PDE4DIP-231, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, human

TSL 4

Gene PDE4DIP, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CUL4B	Q13620	913 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	RAB33A	Q14088	237 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	POTEH	Q6S545	545 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ADSSL1	Q8N142	457 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ITFG1	Q8TB96	612 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	DDX12P	Q92771	950 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	KCND2	Q9NZV8	630 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CDH7	Q9ULB5	785 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	GDA	Q9Y2T3	454 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	F5	P12259	2224 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CEP250	Q9BV73	2442 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CCL16	O15467	120 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	HIP1R	O75146	1068 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	C8A	P07357	584 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	POU2F2	P09086	479 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	OR1D2	P34982	312 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	EFNA5	P52803	228 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	STARD6	P59095	220 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PNOC	Q13519	176 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	POSTN	Q15063	836 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	UPP1	Q16831	310 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	UVSSA	Q2YD98	709 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	XKR4	Q5GH76	650 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	MYCT1	Q8N699	235 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	KIFAP3	Q92845	792 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	FGF13	Q92913	245 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	IFT74	Q96LB3	600 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	DRC1	Q96MC2	740 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	REEP2	Q9BRK0	252 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PANK4	Q9NVE7	773 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CCDC169	A6NNP5	214 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TRAK2	O60296	914 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	LRRN2	O75325	713 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SMC2	O95347	1197 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PRR29	P0C7W0	189 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	GUCY2C	P25092	1073 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CLCNKB	P51801	687 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PPP2R5A	Q15172	486 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PDXDC1	Q6P996	788 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	DAW1	Q8N136	415 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	FOXQ1	Q9C009	403 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TRIM9	Q9C026	710 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	MTRR	Q9UBK8	725 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	COL4A3	Q01955	1670 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259		I3L4J1	428 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259		K7ERI5	159 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ABLIM1	O14639	778 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TBC1D4	O60343	1298 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	B3GAT3	O94766	335 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	MYL1	P05976	194 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SP9	P0CG40	484 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	BRCC3	P46736	316 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PEX3	P56589	373 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	LIN9	Q5TKA1	542 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	RTL10	Q7L3V2	364 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CEP120	Q8N960	986 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SMARCE1	Q969G3	411 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		11.66	□□□□□ -0.54

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