RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531995.1

PUF60-218, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-218ENST00000531995 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 DOCK8Q8NF50 2099 aa20.24■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 GOLGA6L22H0YM25 854 aa20.24■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 SMC2O95347 1197 aa20.24■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 ADH1AP07327 375 aa20.24■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 TNFSF9P41273 254 aa20.24■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 SLC10A6Q3KNW5 377 aa20.24■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 XKR4Q5GH76 650 aa20.24■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa20.24■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 GLYCTKQ8IVS8 523 aa20.24■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 SYCP3Q8IZU3 236 aa20.24■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 CBWD1Q9BRT8 395 aa20.24■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 MFSD1Q9H3U5 465 aa20.24■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 PTGESO14684 152 aa20.23■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 OGTO15294 1046 aa20.23■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 GLUD1P00367 558 aa20.23■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 GARTP22102 1010 aa20.23■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 ISM2Q6H9L7 571 aa20.23■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 SLFN12LQ6IEE8 588 aa20.23■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 PLCD3Q8N3E9 789 aa20.23■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 MSTO1Q9BUK6 570 aa20.23■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 KIAA1468Q9P260 1216 aa20.23■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa20.23■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 GFRA3O60609 400 aa20.22■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 RFPL2O75678 378 aa20.22■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 ADRB2P07550 413 aa20.22■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 SPATA31D3P0C874 917 aa20.22■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 MORC3Q14149 939 aa20.22■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 NAB2Q15742 525 aa20.22■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa20.22■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa20.22■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 OTOP3Q7RTS5 596 aa20.22■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 HACE1Q8IYU2 909 aa20.22■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 FLCNQ8NFG4 579 aa20.22■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 POMGNT1Q8WZA1 660 aa20.22■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 ACAP3Q96P50 834 aa20.22■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 PCIF1Q9H4Z3 704 aa20.22■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa20.22■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 RMND1Q9NWS8 449 aa20.22■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 TRIP11Q15643 1979 aa20.22■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 EFEMP2O95967 443 aa20.21■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 CLTAP09496 248 aa20.21■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 PRCPP42785 496 aa20.21■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP20.21■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 ACOT2P49753 483 aa20.21■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 DSG1Q02413 1049 aa20.21■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 COBLL1Q53SF7 1204 aa20.21■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 FUT10Q6P4F1 479 aa20.21■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 HASPINQ8TF76 798 aa20.21■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 SNX27Q96L92 541 aa20.21■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 VWA8A3KMH1 1905 aa20.21■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 CLUHO75153 1309 aa20.21■□□□□ 0.83
PUF60-218ENST00000531995 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa20.2■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 TTC26A0AVF1 554 aa20.2■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 CLIC2O15247 247 aa20.2■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 CD44P16070 742 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 RPL17P18621 184 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 WNT7BP56706 349 aa20.2■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 GRIK3Q13003 919 aa20.2■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 KIAA0319Q5VV43 1072 aa20.2■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 PALB2Q86YC2 1186 aa20.2■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 C12orf56Q8IXR9 622 aa20.2■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 SAAL1Q96ER3 474 aa20.2■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 PAAF1Q9BRP4 392 aa20.2■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 GPR62Q9BZJ7 368 aa20.2■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 KCNK12Q9HB15 430 aa20.2■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 DMAC2Q9NW81 257 aa20.2■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa20.2■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa20.19■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 GOLGA8IPA6NC78 632 aa20.19■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 CASTOR2A6NHX0 329 aa20.19■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 GOLGA8JA6NMD2 632 aa20.19■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa20.19■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 BIN1O00499 593 aa20.19■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 NARSO43776 548 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 CXCL8P10145 99 aa20.19■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 KCNE1P15382 129 aa20.19■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 TDGQ13569 410 aa20.19■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 ADSSL1Q8N142 457 aa20.19■□□□□ 0.82
PUF60-218ENST00000531995 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
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