RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531298.5

PACS1-211, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene PACS1, Length 547 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-211ENST00000531298 HS6ST3Q8IZP7 471 aa8.06□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa8.06□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 FNIP1Q8TF40 1166 aa8.06□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 BRI3BPQ8WY22 251 aa8.06□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa8.06□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 MAML3Q96JK9 1138 aa8.06□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 SH3GL2Q99962 352 aa8.06□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 SH2D3AQ9BRG2 576 aa8.06□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 TINF2Q9BSI4 451 aa8.06□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 C16orf70Q9BSU1 422 aa8.06□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 BCO2Q9BYV7 579 aa8.06□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 HAPLN2Q9GZV7 340 aa8.06□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 IFT122Q9HBG6 1241 aa8.06□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 PDE11AQ9HCR9 933 aa8.06□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa8.06□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 WDR35Q9P2L0 1181 aa8.06□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 PARP2Q9UGN5 583 aa8.06□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 MTUS1Q9ULD2 1270 aa8.06□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 STRIP2Q9ULQ0 834 aa8.06□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 HPCAL4Q9UM19 191 aa8.06□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 EFR3BQ9Y2G0 817 aa8.06□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 NRCAMQ92823 1304 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 CITO14578 2027 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 A0A1B0GUA9 196 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 TMCO5BA8MYB1 307 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 H3BRB1 525 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 KRIT1O00522 736 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 FSCN2O14926 492 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 MED7O43513 233 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 NCK2O43639 380 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 CEP104O60308 925 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 INSRRP14616 1297 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 PTPN7P35236 360 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 NSFP46459 744 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 ACOT2P49753 483 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 SOX10P56693 466 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 RWDD2BP57060 319 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 COPS2P61201 443 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 NOMO3P69849 1222 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 SP4Q02446 784 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 PPFIA1Q13136 1202 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 BIRC3Q13489 604 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 GPR162Q16538 588 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 AMHR2Q16671 573 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 MORN1Q5T089 497 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 SEL1L2Q5TEA6 688 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 LRIG3Q6UXM1 1119 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 MON1BQ7L1V2 547 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 PALB2Q86YC2 1186 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 NME8Q8N427 588 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 NIPA2Q8N8Q9 360 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 SLC20A1Q8WUM9 679 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 SOCS4Q8WXH5 440 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 TATDN2Q93075 761 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 ARHGEF26Q96DR7 871 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 NCAPGQ9BPX3 1015 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 DNAI2Q9GZS0 605 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 XYLT2Q9H1B5 865 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 EPC1Q9H2F5 836 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 LRRC19Q9H756 370 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 EFCC1Q9HA90 598 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 OSGEPQ9NPF4 335 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 PARVAQ9NVD7 372 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 RASAL2Q9UJF2 1139 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 COG5Q9UP83 839 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 TELO2Q9Y4R8 837 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 CEP83Q9Y592 693 aa8.05□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa8.04□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 GOLGA8KD6RF30 607 aa8.04□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 MYO1FO00160 1098 aa8.04□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 PHF2O75151 1096 aa8.04□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 PHACTR2O75167 634 aa8.04□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 PROSCO94903 275 aa8.04□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 F2P00734 622 aa8.04□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 MMEP08473 750 aa8.04□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 ABCB4P21439 1286 aa8.04□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 MMP8P22894 467 aa8.04□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 GNA15P30679 374 aa8.04□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 CXCR5P32302 372 aa8.04□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 CETN2P41208 172 aa8.04□□□□□ -1.12
PACS1-211ENST00000531298 GRM5P41594 1212 aa8.04□□□□□ -1.12
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