RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 SBNO1A3KN83 1393 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 ATRNL1Q5VV63 1379 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 RPTORQ8N122 1335 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 WNT10BO00744 389 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 LPXNO60711 386 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 IGSF3O75054 1194 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 EYA4O95677 639 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 LAG3P18627 525 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 CRHR1P34998 444 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 UBR7Q8N806 425 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 GPR150Q8NGU9 434 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 RAX2Q96IS3 184 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 TEX101Q9BY14 249 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 CAAP1Q9H8G2 361 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 VTA1Q9NP79 307 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 STK26Q9P289 416 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 PACSIN3Q9UKS6 424 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 HDAC5Q9UQL6 1122 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 RREB1Q92766 1687 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 MARCH11A6NNE9 402 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 DIRC3C9JPN6 131 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 HSD3B2P26439 372 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 BMPR1AP36894 532 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 FLT3LGP49771 235 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 NHLH2Q02577 135 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 STRN3Q13033 797 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 SLC15A2Q16348 729 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 TIGD2Q4W5G0 525 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 FAM47AQ5JRC9 791 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 GIMAP6Q6P9H5 292 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 KCNV1Q6PIU1 500 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 Q6ZVL8 140 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 ARHGEF19Q8IW93 802 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 MDM1Q8TC05 714 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF480Q8WV37 535 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 NEU1Q99519 415 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 AKIP1Q9NQ31 210 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 DPP7Q9UHL4 492 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 EDARQ9UNE0 448 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 MAP3K5Q99683 1374 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF185O15231 689 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 ADCY6O43306 1168 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 PHF2O75151 1096 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 NCR1O76036 304 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 NUDT3O95989 172 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 MASP1P48740 699 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 TAP1Q03518 808 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 OR10H5Q8NGA6 315 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 SLC35B2Q8TB61 432 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 SYBUQ9NX95 663 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-217ENST00000509355 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 PJA2O43164 708 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 BRINP1O60477 761 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 RHOBTB3O94955 611 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 LMNAP02545 664 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 RBP3P10745 1247 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 ADRM1Q16186 407 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 MUM1Q2TAK8 710 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 Q6YL49 198 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 TCP11L2Q8N4U5 519 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 GPR156Q8NFN8 814 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 TOR3AQ9H497 397 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 SERHL2Q9H4I8 314 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 BCO1Q9HAY6 547 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 TECPR2O15040 1411 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 CROCC2H7BZ55 1655 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 CHD4Q14839 1912 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 NUP155O75694 1391 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 GPRASP1Q5JY77 1395 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 AATKQ6ZMQ8 1374 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 IQGAP3Q86VI3 1631 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 B3GALT2O43825 422 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 VIL1P09327 827 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 MGAT1P26572 445 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 PPP3CAQ08209 521 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 TXNRD1Q16881 649 aa6.32□□□□□ -1.4
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