RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NFS1Q9Y697 457 aa16.56■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ALCAMQ13740 583 aa16.55■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 JAMLQ86YT9 394 aa16.55■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa16.55■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPIRE2Q8WWL2 714 aa16.55■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPR20Q99678 358 aa16.55■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MTMR12Q9C0I1 747 aa16.55■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa16.55■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADCYAP1R1P41586 468 aa16.55■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa16.55■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EEF1DP3Q658K8 133 aa16.55■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC105Q8IYK2 499 aa16.55■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MFSD14AQ96MC6 490 aa16.55■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PNMA2Q9UL42 364 aa16.55■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CAND2O75155 1236 aa16.54■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VTNP04004 478 aa16.54■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IQCF3P0C7M6 154 aa16.54■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PYGMP11217 842 aa16.54■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa16.54■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C12orf56Q8IXR9 622 aa16.54■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM71AQ8IYT1 594 aa16.54■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RDM1Q8NG50 284 aa16.54■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATP8B4Q8TF62 1192 aa16.54■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NUP85Q9BW27 656 aa16.54■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KLHL11Q9NVR0 708 aa16.54■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NUB1Q9Y5A7 615 aa16.54■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZBTB42B2RXF5 422 aa16.54■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPSAP08865 295 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARL2P36404 184 aa16.54■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VPS41P49754 854 aa16.54■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MFAP3P55082 362 aa16.54■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPC5P78333 572 aa16.54■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 METTL7BQ6UX53 244 aa16.54■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CD302Q8IX05 232 aa16.54■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa16.54■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ERP44Q9BS26 406 aa16.54■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAB17Q9H0T7 212 aa16.54■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NCANO14594 1321 aa16.54■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATG7O95352 703 aa16.53■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WEE2P0C1S8 567 aa16.53■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CALRP27797 417 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PTENP60484 403 aa16.53■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DPH6Q7L8W6 267 aa16.53■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UBL4BQ8N7F7 174 aa16.53■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SHC3Q92529 594 aa16.53■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYFIP2Q96F07 1278 aa16.53■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CPB2Q96IY4 423 aa16.53■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CARD9Q9H257 536 aa16.53■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM114A2Q9NRY5 505 aa16.53■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLDN3O15551 220 aa16.53■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PDE6CP51160 858 aa16.53■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLCB4Q15147 1175 aa16.53■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 QPCTQ16769 361 aa16.53■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC38Q502W7 563 aa16.53■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARMC3Q5W041 872 aa16.53■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TTC27Q6P3X3 843 aa16.53■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RUFY4Q6ZNE9 571 aa16.53■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C1orf112Q9NSG2 853 aa16.53■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MCM8Q9UJA3 840 aa16.53■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PDHXO00330 501 aa16.53■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EXTL3O43909 919 aa16.53■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EDNRBP24530 442 aa16.53■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANXA13P27216 316 aa16.53■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAP1GAPP47736 663 aa16.53■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 E2F5Q15329 346 aa16.53■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARMCX2Q7L311 632 aa16.53■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C1orf54Q8WWF1 131 aa16.53■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C11orf70Q9BRQ4 267 aa16.53■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NRBP2Q9NSY0 501 aa16.53■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa16.53■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KRT19P08727 400 aa16.52■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADORA2AP29274 412 aa16.52■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ICAM3P32942 547 aa16.52■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NAA25Q14CX7 972 aa16.52■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SEL1L2Q5TEA6 688 aa16.52■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EFCAB12Q6NXP0 572 aa16.52■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRELID2Q8N945 189 aa16.52■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FBXL18Q96ME1 805 aa16.52■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SEMA4AQ9H3S1 761 aa16.52■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 USTQ9Y2C2 406 aa16.52■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SSR1P43307 286 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPP2R2AP63151 447 aa16.52■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GRM1Q13255 1194 aa16.52■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC29A2Q14542 456 aa16.52■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa16.52■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RHOT2Q8IXI1 618 aa16.52■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AFG1LQ8WV93 481 aa16.52■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms