RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC150Q8NCX0 1101 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 ALG3Q92685 438 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 RILPL2Q969X0 211 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 KATNAL1Q9BW62 490 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM8AQ9HCN3 771 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 SLAMF7Q9NQ25 335 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A0B4J269 797 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 ADCY6O43306 1168 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 MPOP05164 745 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 ATP1A3P13637 1013 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 SDHBP21912 280 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 KLRC1P26715 233 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 POLD1P28340 1107 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 CRHR1P34998 444 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 ADCY8P40145 1251 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 MAPKAPK2P49137 400 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 MSMPQ1L6U9 139 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 PHF19Q5T6S3 580 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 AGAP9Q5VTM2 703 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 CD300LDQ6UXZ3 194 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 C2CD5Q86YS7 1000 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 CPOQ8IVL8 374 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 VGLL2Q8N8G2 317 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 HERVK_113Q902F9 699 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 EID2BQ96D98 161 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 UIMC1Q96RL1 719 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM209Q96SK2 561 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 CHST8Q9H2A9 424 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 SAYSD1Q9NPB0 183 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 PRDM7Q9NQW5 492 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 TBC1D23Q9NUY8 699 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 GPRC5DQ9NZD1 345 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 RGL1Q9NZL6 768 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC5A6Q9Y289 635 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 ASNA1O43681 348 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 DDX58O95786 925 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 GABRB3P28472 473 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 TUBP50607 506 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 WNT3AP56704 352 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 TLE2Q04725 743 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 CTBP1Q13363 440 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 TRPC3Q13507 836 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 EFR3AQ14156 821 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC30Q5VVM6 783 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 SPATA1Q5VX52 437 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 KLHL17Q6TDP4 642 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 GATAD2AQ86YP4 633 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 STPG3Q8N7X2 389 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 SNX27Q96L92 541 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 JMJD4Q9H9V9 463 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 IRAK4Q9NWZ3 460 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 FEM1BQ9UK73 627 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 TMX2Q9Y320 296 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 ACTL7AQ9Y615 435 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A0G2JNJ9 132 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM155BO75949 473 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 GFPT2O94808 682 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 ITGA2BP08514 1039 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 GNAI3P08754 354 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 TXNP10599 105 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 IDEP14735 1019 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 RAC2P15153 192 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 FPR1P21462 350 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 COPB2P35606 906 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 ADD2P35612 726 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 GDNFP39905 211 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 PHKA1P46020 1223 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 GNAI1P63096 354 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 FSTL1Q12841 308 aa6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms