RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472760.1

PRPF40A-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF40A, Length 243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-208ENST00000472760 CHST12Q9NRB3 414 aa6.03□□□□□ -1.44
PRPF40A-208ENST00000472760 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 CDHR4A6H8M9 788 aa6.02□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 DRGXA6NNA5 263 aa6.02□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa6.02□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 FRS3O43559 492 aa6.02□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 PEX14O75381 377 aa6.02□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 MATN4O95460 622 aa6.02□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 ITGB1P05556 798 aa6.02□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 MYL3P08590 195 aa6.02□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 SLC6A2P23975 617 aa6.02□□□□□ -1.45
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PRPF40A-208ENST00000472760 CHN2P52757 468 aa6.02□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 ICAM4Q14773 271 aa6.02□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 NFIXQ14938 502 aa6.02□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 CSRP2Q16527 193 aa6.02□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 ERICH6BQ5W0A0 696 aa6.02□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa6.02□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 Q6ZSN1 163 aa6.02□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 DNERQ8NFT8 737 aa6.02□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 ANKS1AQ92625 1134 aa6.02□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 PGBD4Q96DM1 585 aa6.02□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 APIPQ96GX9 242 aa6.02□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 LOXL4Q96JB6 756 aa6.02□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 MRGPRX1Q96LB2 322 aa6.02□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 MNTQ99583 582 aa6.02□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 GPR87Q9BY21 358 aa6.02□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 ZNF700Q9H0M5 742 aa6.02□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 DEF6Q9H4E7 631 aa6.02□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 RLIMQ9NVW2 624 aa6.02□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 OGDHLQ9ULD0 1010 aa6.02□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 SLC45A2Q9UMX9 530 aa6.02□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 USP19O94966 1318 aa6.01□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 AGFG2O95081 481 aa6.01□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 ANXA1P04083 346 aa6.01□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 GNAI2P04899 355 aa6.01□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 BRAFP15056 766 aa6.01□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 NPR1P16066 1061 aa6.01□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 MAN2A2P49641 1150 aa6.01□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 KIF22Q14807 665 aa6.01□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 EMC10Q5UCC4 262 aa6.01□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa6.01□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 PDSS2Q86YH6 399 aa6.01□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 CHST13Q8NET6 341 aa6.01□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 PARD3BQ8TEW8 1205 aa6.01□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 SUCLG2Q96I99 432 aa6.01□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 TNIP3Q96KP6 325 aa6.01□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 ZNF287Q9HBT7 754 aa6.01□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 TCAF1Q9Y4C2 921 aa6.01□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP6.01□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 PRSS29PA6NIE9 313 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 ZNF785A8K8V0 405 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 RHPN2P1A8MT19 583 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 ISM1B1AKI9 464 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 RARBP10826 455 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 SLC5A1P13866 664 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 RABGGTBP53611 331 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 NHLH2Q02577 135 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 PLP2Q04941 152 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 CRHR2Q13324 411 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 BIRC2Q13490 618 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 CNGA2Q16280 664 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 KRT78Q8N1N4 520 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 SLC17A8Q8NDX2 589 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 ADOQ96SZ5 270 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 TBCBQ99426 244 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 IMPG2Q9BZV3 1241 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 PHTF1Q9UMS5 762 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 SNX13Q9Y5W8 968 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 BTBD11A6QL63 1104 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 MYO1FO00160 1098 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 TBX3O15119 743 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 TBC1D4O60343 1298 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 CKBP12277 381 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 RPL17P18621 184 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 AK2P54819 239 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 C1QL3Q5VWW1 255 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 TSHZ3Q63HK5 1081 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 ZNF783Q6ZMS7 281 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 Q6ZRM9 215 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 TTLL10Q6ZVT0 673 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 SYT12Q8IV01 421 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 SAMD3Q8N6K7 520 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 OR6B3Q8NGW1 331 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-208ENST00000472760 EDAQ92838 391 aa5.99□□□□□ -1.45
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