RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428818.5

TTC28-AS1-208, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene TTC28-AS1, Length 706 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-208ENST00000428818 NRIP1P48552 1158 aa10.24□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CASP4P49662 377 aa10.24□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PMS1P54277 932 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 YARSP54577 528 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 UBE2HP62256 183 aa10.24□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PLCB3Q01970 1234 aa10.24□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PPP2R3AQ06190 1150 aa10.24□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ALCAMQ13740 583 aa10.24□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PTPN14Q15678 1187 aa10.24□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CLUL1Q15846 466 aa10.24□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CAMK4Q16566 473 aa10.24□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 TIGD5Q53EQ6 642 aa10.24□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 RTP2Q5QGT7 225 aa10.24□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 LLGL2Q6P1M3 1020 aa10.24□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CLEC17AQ6ZS10 378 aa10.24□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 VPS52Q8N1B4 723 aa10.24□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SLC17A8Q8NDX2 589 aa10.24□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 GPT2Q8TD30 523 aa10.24□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ELMO3Q96BJ8 720 aa10.24□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 IGFLR1Q9H665 355 aa10.24□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PDE11AQ9HCR9 933 aa10.24□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ADAM28Q9UKQ2 775 aa10.24□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 EXOC7Q9UPT5 735 aa10.24□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 FAN1Q9Y2M0 1017 aa10.24□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 GREB1Q4ZG55 1949 aa10.24□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 DENND4CQ5VZ89 1909 aa10.24□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 MYO16Q9Y6X6 1858 aa10.23□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 TRIM49BA6NDI0 452 aa10.23□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 C2orf71A6NGG8 1288 aa10.23□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ADAM12O43184 909 aa10.23□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 KINO60870 393 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 GARTP22102 1010 aa10.23□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 TKTP29401 623 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 KCNB1Q14721 858 aa10.23□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 UPP1Q16831 310 aa10.23□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 GLYCTKQ8IVS8 523 aa10.23□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SPATA20Q8TB22 786 aa10.23□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 EEF2KMTQ96G04 330 aa10.23□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 MTMR12Q9C0I1 747 aa10.23□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 LMAN2LQ9H0V9 348 aa10.23□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 KANSL3Q9P2N6 904 aa10.23□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PATJQ8NI35 1801 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 H3BQ06 376 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SPTLC1O15269 473 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 EXTL3O43909 919 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SOD2P04179 222 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 MYL1P05976 194 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CTSAP10619 480 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CD46P15529 392 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 LTBRP36941 435 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 KCNQ1P51787 676 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 UBE3AQ05086 875 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 TMEM132DQ14C87 1099 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ZBTB6Q15916 424 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PTPROQ16827 1216 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 DUSP6Q16828 381 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ZCWPW2Q504Y3 356 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 KANK3Q6NY19 840 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 TMC7Q7Z402 723 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 GPD1LQ8N335 351 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 RDH13Q8NBN7 331 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 OR5B17Q8NGF7 314 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SMARCE1Q969G3 411 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 TIGD1Q96MW7 591 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 APOL5Q9BWW9 433 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 TMEM206Q9H813 350 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 KCNG1Q9UIX4 513 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 LZTS1Q9Y250 596 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 BDP1A6H8Y1 2624 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 MYO10Q9HD67 2058 aa10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 LILRB3O75022 631 aa10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 B3GAT3O94766 335 aa10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 NR3C1P04150 777 aa10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 EPCAMP16422 314 aa10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SCP2P22307 547 aa10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PRCPP42785 496 aa10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 GLUD2P49448 558 aa10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CDR1P51861 262 aa10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CYP24A1Q07973 514 aa10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 C9orf57Q5W0N0 161 aa10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SLFN12LQ6IEE8 588 aa10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.8 ms