RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428584.5

TTC28-AS1-207, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 5,859 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IL17RAQ96F46 866 aa15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ELMO2Q96JJ3 720 aa15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HMOX2P30519 316 aa15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 VEPH1Q14D04 833 aa15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LRRC8BQ6P9F7 803 aa15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LPAR1Q92633 364 aa15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SH3KBP1Q96B97 665 aa15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRIM10Q9UDY6 481 aa15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PJA2O43164 708 aa15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MYL2P10916 166 aa15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ANO4Q32M45 955 aa15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RNF149Q8NC42 400 aa15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ADNPQ9H2P0 1102 aa15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF543Q08ER8 600 aa15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SPATA17Q96L03 361 aa15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MED15Q96RN5 788 aa15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CRAMP1Q96RY5 1269 aa15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SPON2Q9BUD6 331 aa15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 AFF2P51816 1311 aa15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MYBP10242 640 aa15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RBP5P82980 135 aa15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RAD9BQ6WBX8 426 aa15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 APPL2Q8NEU8 664 aa15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PPP1R36Q96LQ0 422 aa15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TJP2Q9UDY2 1190 aa15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FHOD1Q9Y613 1164 aa15.66■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TLR2O60603 784 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SUPT3HO75486 399 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LSP1P33241 339 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 USP38Q8NB14 1042 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PCMTD2Q9NV79 361 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KDM1AO60341 852 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TBC1D4O60343 1298 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 XKR3Q5GH77 459 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PRUNE1Q86TP1 453 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CYFIP2Q96F07 1278 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MTMR4Q9NYA4 1195 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PAK5Q9P286 719 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MYMKA6NI61 221 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RANBP1P43487 201 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ANKS3Q6ZW76 656 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C4orf33Q8N1A6 199 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RAB42Q8N4Z0 105 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ATPAF2Q8N5M1 289 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DTX3LQ8TDB6 740 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SEPT8Q92599 483 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCDC134Q9H6E4 229 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RAB6BQ9NRW1 208 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FAM205CA6NFA0 338 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 APRTP07741 180 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 STAT5BP51692 787 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FBXW10Q5XX13 1052 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ADCK1Q86TW2 530 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF677Q86XU0 584 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF229Q9UJW7 825 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 AKAP10O43572 662 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CPB1P15086 417 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KLC1Q07866 573 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NCOA4Q13772 614 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 WDR72Q3MJ13 1102 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ACCSLQ4AC99 568 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RRM2BQ7LG56 351 aa15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C19orf81C9J6K1 198 aa15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 P4HA2O15460 535 aa15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRAPPC3O43617 180 aa15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRT8P05787 483 aa15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PDGFRAP16234 1089 aa15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KCNA3P22001 575 aa15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BCORL1Q5H9F3 1711 aa15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C4orf22Q6V702 233 aa15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZIM3Q96PE6 472 aa15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IQCA1LA6NCM1 817 aa15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ERP27Q96DN0 273 aa15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms