RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427110.6

PTPRC-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 264 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-208ENST00000427110 PRR18Q8N4B5 295 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-208ENST00000427110 SH2D3CQ8N5H7 860 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-208ENST00000427110 ZBTB34Q8NCN2 500 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-208ENST00000427110 C3orf20Q8ND61 904 aa3.1□□□□□ -1.91
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PTPRC-208ENST00000427110 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 DSC2Q02487 901 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 RESTQ13127 1097 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP3.08□□□□□ -1.92
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