RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409025.5

USP39-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP39, Length 1,946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-202ENST00000409025 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa20.27■□□□□ 0.84
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USP39-202ENST00000409025 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
USP39-202ENST00000409025 NFICP08651 508 aa20.27■□□□□ 0.84
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USP39-202ENST00000409025 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
USP39-202ENST00000409025 LONRF2Q1L5Z9 754 aa20.27■□□□□ 0.84
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USP39-202ENST00000409025 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
USP39-202ENST00000409025 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
USP39-202ENST00000409025 LRRC1Q9BTT6 524 aa20.27■□□□□ 0.84
USP39-202ENST00000409025 KATNAL1Q9BW62 490 aa20.27■□□□□ 0.84
USP39-202ENST00000409025 OGFRQ9NZT2 677 aa20.27■□□□□ 0.84
USP39-202ENST00000409025 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
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USP39-202ENST00000409025 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa20.25■□□□□ 0.83
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USP39-202ENST00000409025 CENPCQ03188 943 aa20.25■□□□□ 0.83
USP39-202ENST00000409025 MESDQ14696 234 aa20.25■□□□□ 0.83
USP39-202ENST00000409025 SLC10A6Q3KNW5 377 aa20.25■□□□□ 0.83
USP39-202ENST00000409025 NAA35Q5VZE5 725 aa20.25■□□□□ 0.83
USP39-202ENST00000409025 C8orf74Q6P047 294 aa20.25■□□□□ 0.83
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USP39-202ENST00000409025 CPA5Q8WXQ8 436 aa20.25■□□□□ 0.83
USP39-202ENST00000409025 CYFIP2Q96F07 1278 aa20.25■□□□□ 0.83
USP39-202ENST00000409025 RPS6KC1Q96S38 1066 aa20.25■□□□□ 0.83
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USP39-202ENST00000409025 C1orf127Q8N9H9 656 aa20.25■□□□□ 0.83
USP39-202ENST00000409025 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa20.25■□□□□ 0.83
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USP39-202ENST00000409025 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
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USP39-202ENST00000409025 ZNF667Q5HYK9 610 aa20.24■□□□□ 0.83
USP39-202ENST00000409025 UBL4BQ8N7F7 174 aa20.24■□□□□ 0.83
USP39-202ENST00000409025 FAXDC2Q96IV6 333 aa20.24■□□□□ 0.83
USP39-202ENST00000409025 ZIC5Q96T25 663 aa20.24■□□□□ 0.83
USP39-202ENST00000409025 SIX4Q9UIU6 781 aa20.24■□□□□ 0.83
USP39-202ENST00000409025 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
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USP39-202ENST00000409025 TBC1D8O95759 1140 aa20.23■□□□□ 0.83
USP39-202ENST00000409025 TMEM132DQ14C87 1099 aa20.23■□□□□ 0.83
USP39-202ENST00000409025 MAP9Q49MG5 647 aa20.23■□□□□ 0.83
USP39-202ENST00000409025 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa20.23■□□□□ 0.83
USP39-202ENST00000409025 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
USP39-202ENST00000409025 CD302Q8IX05 232 aa20.23■□□□□ 0.83
USP39-202ENST00000409025 ZNF606Q8WXB4 792 aa20.23■□□□□ 0.83
USP39-202ENST00000409025 OSMRQ99650 979 aa20.23■□□□□ 0.83
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USP39-202ENST00000409025 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
USP39-202ENST00000409025 TMEM59LQ9UK28 342 aa20.23■□□□□ 0.83
USP39-202ENST00000409025 C17orf102A2RUQ5 167 aa20.23■□□□□ 0.83
USP39-202ENST00000409025 TMEM88BA6NKF7 163 aa20.23■□□□□ 0.83
USP39-202ENST00000409025 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
USP39-202ENST00000409025 ITGB3P05106 788 aa20.23■□□□□ 0.83
USP39-202ENST00000409025 WEE2P0C1S8 567 aa20.23■□□□□ 0.83
USP39-202ENST00000409025 DARSP14868 501 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
USP39-202ENST00000409025 COMTP21964 271 aa20.23■□□□□ 0.83
USP39-202ENST00000409025 ATICP31939 592 aa20.23■□□□□ 0.83
USP39-202ENST00000409025 PSMC4P43686 418 aa20.23■□□□□ 0.83
USP39-202ENST00000409025 NOMO3P69849 1222 aa20.23■□□□□ 0.83
USP39-202ENST00000409025 HIC1Q14526 733 aa20.23■□□□□ 0.83
USP39-202ENST00000409025 LIN9Q5TKA1 542 aa20.23■□□□□ 0.83
USP39-202ENST00000409025 MFSD14CQ5VZR4 134 aa20.23■□□□□ 0.83
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