RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 ISCUQ9H1K1 167 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 FOXP2O15409 715 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 UCHL3P15374 230 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 DNAJC3Q13217 504 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 ITPK1Q13572 414 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 WDR93Q6P2C0 686 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 SLC30A5Q8TAD4 765 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 PFASO15067 1338 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 DPYSL4O14531 572 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 SLC9A1P19634 815 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 SCP2P22307 547 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 AP1B1Q10567 949 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 BARGINQ6ZT62 677 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 SP8Q8IXZ3 490 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 FOPNLQ96NB1 174 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 RHBDL2Q9NX52 303 aa9.33□□□□□ -0.92
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PTPRM-202ENST00000400053 PNMA3Q9UL41 463 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 GGPS1O95749 300 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 C4BPBP20851 252 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 TSPY1Q01534 308 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 CRYMQ14894 314 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 MCPH1Q8NEM0 835 aa9.32□□□□□ -0.92
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PTPRM-202ENST00000400053 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 NWD1Q149M9 1564 aa9.32□□□□□ -0.92
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PTPRM-202ENST00000400053 PHF2O75151 1096 aa9.32□□□□□ -0.92
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PTPRM-202ENST00000400053 RASA1P20936 1047 aa9.32□□□□□ -0.92
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PTPRM-202ENST00000400053 ARPP19P56211 112 aa9.32□□□□□ -0.92
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PTPRM-202ENST00000400053 MEI1Q5TIA1 1274 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 FOXR1Q6PIV2 292 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 KDM7AQ6ZMT4 941 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 SH3TC2Q8TF17 1288 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 LACRTQ9GZZ8 138 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 MOSPD1Q9UJG1 213 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 RAD17O75943 681 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 NMT1P30419 496 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 PRELPP51888 382 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 BCAR1P56945 870 aa9.32□□□□□ -0.92
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PTPRM-202ENST00000400053 P3H1Q32P28 736 aa9.32□□□□□ -0.92
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PTPRM-202ENST00000400053 DTNBP1Q96EV8 351 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 PALMDQ9NP74 551 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 HACD3Q9P035 362 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 FLT1P17948 1338 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 E5RI56 91 aa9.32□□□□□ -0.92
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PTPRM-202ENST00000400053 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 PMS1P54277 932 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 FRMD5Q7Z6J6 570 aa9.32□□□□□ -0.92
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PTPRM-202ENST00000400053 NLRP4Q96MN2 994 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 NDEL1Q9GZM8 345 aa9.32□□□□□ -0.92
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PTPRM-202ENST00000400053 PKD2L2Q9NZM6 624 aa9.32□□□□□ -0.92
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PTPRM-202ENST00000400053 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa9.32□□□□□ -0.92
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PTPRM-202ENST00000400053 LOC100653049A0A140TA62 436 aa9.31□□□□□ -0.92
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PTPRM-202ENST00000400053 KRT34O76011 436 aa9.31□□□□□ -0.92
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PTPRM-202ENST00000400053 KRT7P08729 469 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 PDHBP11177 359 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 ATP6V1B1P15313 513 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 TARSP26639 723 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 GNA15P30679 374 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 HADHAP40939 763 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 JAK3P52333 1124 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 DEFA1P59665 94 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 DEFA3P59666 94 aa9.31□□□□□ -0.92
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