RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391183.1

RNU6-1197P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1197, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1197P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1197P-201ENST00000391183 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 FEM1BQ9UK73 627 aa3.71□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 FBXO10Q9UK96 956 aa3.71□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 A0A1W2PPH5 198 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 ASNA1O43681 348 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 ZBED4O75132 1171 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 GPR32O75388 356 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 TIPRLO75663 272 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 FSBPO95073 299 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 MATN4O95460 622 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 ABHD16AO95870 558 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 CYBBP04839 570 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 RPN1P04843 607 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 ITGA2BP08514 1039 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 IDEP14735 1019 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 IL1R1P14778 569 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 KLRC1P26715 233 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 COL8A1P27658 744 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 SREBF1P36956 1147 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 MAN2A2P49641 1150 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 CTXN1P60606 82 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 ATP8B2P98198 1209 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 PRKCQQ04759 706 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 UBE3AQ05086 875 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 MAP3K12Q12852 859 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 NFIAQ12857 509 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 CTBP1Q13363 440 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 RAB32Q13637 225 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 PLCL1Q15111 1095 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 DLGAP5Q15398 846 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 VASNQ6EMK4 673 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 PAQR3Q6TCH7 311 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 KLHL17Q6TDP4 642 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 LIPIQ6XZB0 460 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 GATAD2AQ86YP4 633 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 MIB1Q86YT6 1006 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 PDZD8Q8NEN9 1154 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 ZNF384Q8TF68 577 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 ZNF480Q8WV37 535 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 THAP4Q8WY91 577 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 HVCN1Q96D96 273 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 SNX27Q96L92 541 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 ALPK1Q96QP1 1244 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 NELL2Q99435 816 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 SDF4Q9BRK5 362 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 LDAHQ9H6V9 325 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 MLXIPQ9HAP2 919 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 LANCL2Q9NS86 450 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 TMEM160Q9NX00 188 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 RBPJLQ9UBG7 517 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 DNAI1Q9UI46 699 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 TMEM59LQ9UK28 342 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 VAV3Q9UKW4 847 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 FITM1A5D6W6 292 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 HMX3A6NHT5 357 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 F8W031 263 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 N4BP3O15049 544 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 USO1O60763 962 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 ACTL6BO94805 426 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 EFEMP2O95967 443 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 GAAP10253 952 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 RARBP10826 455 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 NCAM1P13591 858 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 PNLIPP16233 465 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 KRT20P35900 424 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 ARL4AP40617 200 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 COPAP53621 1224 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 PNLIPRP1P54315 467 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 IL13RA1P78552 427 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 CD83Q01151 205 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 IKZF1Q13422 519 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 MTM1Q13496 603 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 LRP8Q14114 963 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 SURF1Q15526 300 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 MEA1Q16626 185 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 FAM26FQ5R3K3 315 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 FAM205BPQ63HN1 556 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 PRR23CQ6ZRP0 262 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 USP49Q70CQ1 688 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 TAS1R1Q7RTX1 841 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-1197P-201ENST00000391183 KRT28Q7Z3Y7 464 aa3.69□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms