RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329276.9

NOP56-201, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOP56, Length 2,400 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-201ENST00000329276 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa20.47■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 SFI1A8K8P3 1242 aa20.47■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 SMAPO00193 183 aa20.47■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 EML1O00423 815 aa20.47■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 KCNQ2O43526 872 aa20.47■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 CYP4A11Q02928 519 aa20.47■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 ITPK1Q13572 414 aa20.47■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 CCNG2Q16589 344 aa20.47■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 TTBK2Q6IQ55 1244 aa20.47■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 C1orf186Q6ZWK4 172 aa20.47■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 KIAA0825Q8IV33 1275 aa20.47■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 ARHGEF19Q8IW93 802 aa20.47■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 FAM178BQ8IXR5 827 aa20.47■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 VPS52Q8N1B4 723 aa20.47■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 IKZF4Q9H2S9 585 aa20.47■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 BCAS3Q9H6U6 928 aa20.47■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 LMCD1Q9NZU5 365 aa20.47■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 SLC24A2Q9UI40 661 aa20.47■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 UMODL1Q5DID0 1318 aa20.47■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 ZBED4O75132 1171 aa20.46■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 SLC1A1P43005 524 aa20.46■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 SLC1A5Q15758 541 aa20.46■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 EPC2Q52LR7 807 aa20.46■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 CYP4F22Q6NT55 531 aa20.46■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 FIZ1Q96SL8 496 aa20.46■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 VAV3Q9UKW4 847 aa20.46■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 SBF2Q86WG5 1849 aa20.46■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 SGPL1O95470 568 aa20.46■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 RASA3Q14644 834 aa20.46■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 KRT72Q14CN4 511 aa20.46■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 CCNJLQ8IV13 435 aa20.46■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 SLF2Q8IX21 1173 aa20.46■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa20.46■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 COL24A1Q17RW2 1714 aa20.46■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 EMSYQ7Z589 1322 aa20.45■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 F8W8V4 182 aa20.45■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 VPS41P49754 854 aa20.45■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 RHBDL3P58872 404 aa20.45■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 FMO1Q01740 532 aa20.45■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 PTP4A2Q12974 167 aa20.45■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 FAM81BQ96LP2 452 aa20.45■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 CENPKQ9BS16 269 aa20.45■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 SPATA16Q9BXB7 569 aa20.45■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 ZWILCHQ9H900 591 aa20.45■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 TUFT1Q9NNX1 390 aa20.45■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 KCND2Q9NZV8 630 aa20.45■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 PIK3CDO00329 1044 aa20.45■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 PENKP01210 267 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 LYNP07948 512 aa20.45■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 SLC16A2P36021 539 aa20.45■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 GABPAQ06546 454 aa20.45■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 RASIP1Q5U651 963 aa20.45■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 LVRNQ6Q4G3 990 aa20.45■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 PRUNE1Q86TP1 453 aa20.45■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 TMEM174Q8WUU8 243 aa20.45■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 NDNQ99608 321 aa20.45■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 TRIM55Q9BYV6 548 aa20.45■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa20.45■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 ATRNL1Q5VV63 1379 aa20.44■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 MEIS2O14770 477 aa20.44■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 PMM2O15305 246 aa20.44■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 AKR1B1P15121 316 aa20.44■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 EIF6P56537 245 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa20.44■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 ARMC3Q5W041 872 aa20.44■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 CCDC62Q6P9F0 684 aa20.44■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 C4orf33Q8N1A6 199 aa20.44■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 OLFM3Q96PB7 478 aa20.44■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 IWS1Q96ST2 819 aa20.44■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 KRT82Q9NSB4 513 aa20.44■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 DNAJB4Q9UDY4 337 aa20.44■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 FOSP01100 380 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 MAPK4P31152 587 aa20.44■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 CIITAP33076 1130 aa20.44■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 CETN2P41208 172 aa20.44■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 CNPY1Q3B7I2 92 aa20.44■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 HAPLN3Q96S86 360 aa20.44■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 OSBPL8Q9BZF1 889 aa20.44■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 SAYSD1Q9NPB0 183 aa20.44■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 ARL8BQ9NVJ2 186 aa20.44■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 ATXN10Q9UBB4 475 aa20.44■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 FOCADQ5VW36 1801 aa20.43■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 CFAP69A5D8W1 941 aa20.43■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 F5H6K3 240 aa20.43■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa20.43■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 KLRC2P26717 231 aa20.43■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 SREBF1P36956 1147 aa20.43■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 VAMP7P51809 220 aa20.43■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 RAP1GDS1P52306 607 aa20.43■□□□□ 0.86
NOP56-201ENST00000329276 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.867e-10■■■■■ 27.2
NOP56-201ENST00000329276 LLGL1Q15334 1064 aa20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms